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单细胞ATAC(10x)测序项目（JJ20250045）采购公告
招标详情
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***********公司企业信息
| 单细胞ATAC(10x)测序项目 | 项目编号**** | |
| 2025-06-10 18:39:47 | 公告截止日期2025-06-16 09:00:00 | |
| **** | 付款方式1.所有货物经甲乙双方验收合格并签署验收单，甲方原则上在乙方提供全额发票（国产设备须提供增值税专用发票）及供货清单后10****银行电汇方式付给乙方全额货款。乙方在合同签订前缴纳中标金额的5%作为履约保证金，验收合格后退还。 | |
| 联系电话 | ||
| 成交后3个工作日内 | 到货时间要求合同签订后，乙方收到检测样品20个工作日内出具服务数据 | |
| 250,000.00 | ||
| 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 | ||
采购清单1
| 单细胞ATAC(10x)测序项目 | 25 | 项 |
| 10,000.00 |
| 服务平台要求： 1基于10x Genomics平台的单细胞捕获技术，通过制备细胞核悬液，用Tn5转座酶对染色质开放区的DNA进行剪切获得单细胞水平的染色质开放情况。 服务数据产出质量和数量要求： 1)文库峰形呈三峰状,三个主峰介于100bp-1000bp；2)DNA文库浓度≥1.5nM； 3)文库测序数据量≥400M reads； 4)Q30>85％； 5)测序数据基因组比对率≥80%； 6)目标捕获细胞数浮动范围在20%以内； 7)Fraction of high-quality fragments overlapping peaks > 25%； 8)Median high-quality fragments per cell > 10000； 9)TSS score > 4； 10)每个样品细胞捕获数量8000-13000之间，鉴定的细胞类型正常，包含组织实质细胞和免疫细胞等类群，与已发表文献无很大偏差； 服务分析要求 1）标准分析：a、测序数据质控：各个样本测序数据质控（reads数、测序饱和度等）与Cell Ranger分析结果质控（Estimated number of cells，Median high-quality fragments per cell，Fraction of high-quality fragments overlapping peaks等）；b、Peak对应的基因和区域注释；c、Peak的可视化分析及展示：基因热图、基因Feature plot图、基因Dot plot图等；d、细胞Cluster/样本间peak差异分析：peak差异火山图、peak表达MA图；e、功能富集分析：peak注释基因的GO功能富集分析、KEGG功能富集分析；f、细胞聚类图：细胞群体cluster聚类、t-SNE聚类及可视化，基因对应peak的可视化图；g、细胞注释图 2）高级分析内容Motif富集分析，Promoter富集分析，GSEA功能富集分析，GSVA功能富集分析，Cluster/cell/sample间相关性分析，多样本整合分析，WGCNA分析，单细胞转录组-单细胞ATAC相关性分析(需要单细胞转录组数据)等。 3）定制化分析内容a、提供邮箱、电话、微信群、线上线下会议等多种方式进行沟通和数据分析探讨；b、利用公司单细胞测序行业专业优势，及时掌握领域研究进展和情报，遇到严峻竞争事态时，向甲方提供预警和差异化研究方案；c、结合公司已有的领域知识和单细胞数据分析经验，对个性化数据分析结果进行解读研判，并制定下一步数据分析方案；d、对于文章投递过程中审稿人的提问及时协助解答，对于补充数据分析按要求进行数据分析并及时提供分析结果；e、免费进行其它合理的定制化数据分析。 |
| 商品承诺:送货上门/安装调试/技术培训;免费售后分析两年; |
****计划财务****服务中心）
2025-06-10 18:39:47
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