水环境DNA检测项目

服务类

项目名称：水环境DNA检测项目

采购需求：（1）对200个水样进行环境DNA监测工作。（2）水样环境DNA（eDNA）提取，采用适宜的前处理及提取方法，确保所得核酸的纯度、完整度及浓度满足下游实验要求。（3）针对原核藻类（蓝藻门）16S rRNA基因及真核藻类（如绿藻门、硅藻门等）18S rRNA或ITS区域设计特异性引物，进行PCR扩增；同时，对总DNA构建宏基因组测序文库，利用高通量测序平台完成扩增子测序（覆盖原核及真核藻类）和鸟枪法宏基因组测序。其中，宏基因组测序每个样品有效数据量不低于10 Gb，测序质量Q30≥85%。（4）基于扩增子测序数据进行藻类生物多样性和物种组成分析，包括α多样性指数（如Shannon、Chao1）、β多样性（基于Bray-Curtis等距离算法）、物种注释（至属或种水平）及相对丰度比较；基于宏基因组测序数据进行功能基因解析，重点鉴定产异味物质相关基因（如土臭素、2-甲基异莰醇合成基因等）及藻毒素合成相关功能基因（如微囊藻毒素、柱孢藻毒素、鱼腥藻毒素基因等），并明确功能基因的序列特征、覆盖度及相对丰度。（5）制定覆盖eDNA提取、PCR扩增、文库制备、高通量测序及生物信息学分析全流程的标准化操作规范（SOP），内容须包括试剂耗材品牌/货号、仪器参数设置、质控指标（如DNA纯度、扩增效率、测序数据过滤标准）、分析流程及参数说明，确保方法在不同批次的实验和数据分析中具有高度可重复性与可追溯性。提交测序原始数据（FASTQ格式）、生物信息学分析报告（含图表及注释）以及完整的SOP文档。

合同履行期限：自采购合同签订之日起至2026年12月30日前完成全部采购内容。