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玫瑰茄全基因组图谱开发（EJWJ2024157）延期公告

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福建 -福州

发布时间： 2024年06月30日

摘要信息

招标单位

招标编号

招标估价

招标联系人

招标代理机构

代理联系人

报名截止时间

投标截止时间

关键信息

玫瑰茄

招标详情

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相关单位：

***********公司企业信息

项目名称项目编号公告开始日期公告截止日期采购单位付款方式联系人联系电话签约时间要求到货时间要求预算总价发票要求含税要求送货要求安装要求收货地址供应商资质要求公告说明

玫瑰茄全基因组图谱开发	****
2024-06-27 11:22:46	2024-07-03 14:00:00
****	待结题报告交付后，付全款。


￥49500.00





符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

采购清单1

采购商品采购数量计量单位所属分类

玫瑰茄全基因组图谱开发

项

农学研究服务

品牌型号预算单价技术参数及配置要求参考链接售后服务

￥ 49500.00

1、完成玫瑰茄样品的DNA提取，质检合格后构建三代测序基因组文库进行PacBio Revio测序技术平台HIFI测序模式测序并进行数据质控，测序数据量60Gb；构建二代测序基因组文库进行DNB-SEQ测序平台PE150测序策略测序并进行数据质控，测序数据量50G； 2、完成玫瑰茄样品的甲醛交联、细胞核提取，构建1个Hi-C文库，质检后基于illumina测序平台进行测序。测序数据量200Gb； 3、完成4个玫瑰茄不同组织样品的RNA提取，质检合格后进行基于DNB-SEQ平台进行常规转录组测序，测序数据量6G；****组织部位玫瑰茄样品进行RNA提取，质检合格后基于Nanopore平台进行转录组测序，测序数据量10G；完成测序后进行HIFI单倍型基因组图谱分析，分析内容如下：(1)数据质控；(2)单倍型基因组组装（共组装2套）（组装、组装结果评估）；(3)HIC辅助基因组拼接，比对参考基因组，将组装得到的Contig挂载到染色体，挂载率>90%；(4)基因组注释基因组注释（重复序列注释、基因结构注释、基因功能注释、ncRNA注释）；(5)比较基因组学分析（基因家族分析、系统进化分析）；(6)单倍型基因组特有分析、亚基因组结构变异分析、亚基因组不对称进化分析（Ka/Ks差异分析）等位基因表达偏岐分析； 4、1）供应商样本提取合格率≥98%，对于DNA提取不合格样本，提取到合格为止。 2）供应商针对检测合格后的样品(样本总量≥ 100ng)，搭配自动化建库仪器，通量做到1人/4H/96个样本。 3）供应商拥有自主nanopore测序仪并服务过使用Nanopore平台测序的用户，并发表过文章。

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