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茶叶转录组测序招标（EJWJ2024265）采购公告

公告-招标公告

福建 -福州

发布时间： 2024年09月27日

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项目名称项目编号公告开始日期公告截止日期采购单位付款方式联系人联系电话签约时间要求到货时间要求预算总价发票要求含税要求送货要求安装要求收货地址供应商资质要求公告说明

茶叶转录组测序招标	****
2024-09-27 11:39:26	2024-09-30 13:00:00
****	货到验收付款


￥40000.00





符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

采购清单1

采购商品采购数量计量单位所属分类

茶叶转录组测序招标

批

农学研究服务

品牌型号预算单价技术参数及配置要求参考链接售后服务

￥ 40000.00

1、完成28个茶叶样品RNA提取，每个样本3个重复，样品质检合格后进行常规转录组测序，illumina测序数据量6G，并进行生物信息学分析； 2、转录组分析内容如下： 2.1.数据质控：对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads 的处理 2.2比对分析：比对核糖体序列、参考基因组（或其他参考序列） 2.3. 基因分析： 1) 新基因鉴定 2) 基因类型统计 3) 基因覆盖度统计 4) 测序饱和度分析 5) 基因测序随机性分析 2.4. 基因表达量统计（表达量计算，表达量丰度分布） 2.5. 样本关系分析（基于表达量）： 1) 主成分分析（PCA） 2) 相关性系数热图 2.6. 组间差异分析： 1) 差异基因整体统计 2) 差异比较火山图 3) 差异基因聚类热图 4) 差异基因GO富集分析（富集圈图、富集气泡图、柱形图绘制、差异富集气泡图、富集条形图） 5) 差异基因KEGG富集分析（富集圈图、富集气泡图、柱形图绘制、差异富集气泡图、富集条形图） 6) 差异基因Reactome富集分析（富集圈图、富集气泡图、柱形图绘制、差异富集气泡图、富集条形图，仅限部分物种） 2.7. 互作网络分析（PPI分析） 1) String数据库蛋白互作网络分析 2) 网络图绘制 2.8. GSEA分析 (Gene Set Enrichment Analysis) 1) 基于GSEA的GO富集分析 2) 基于GSEA的KEGG富集分析 3) 基于GSEA的Reactome富集分析（仅限部分物种） 2.9. 趋势分析 2.10. 基因可变剪切鉴定 3. 技术要求交付动态结题报告，数据可在云平台上进行在线分析 4.项目周期要求：30天。