****关于冷杉心腐病菌多组学联合测序项目公开询价的公告
根据科研需要,我所拟开展1套冷杉心腐病菌多组学联合测序项目,具体测序内容详见附件。现进行公开询价。
一、询价内容
1.转录组样本信息及测序内容
1)样本来源: 冷杉组织 ;
2)样本形式: 组织样品 ;
3)样本数量: 230 个;
4)完成 230 个样本RNA提取;
5)完成 230 个样本的RNA质检;
6)mRNA分离;
7)双链cDNA合成;
8)完成以下表格要求的文库构建和测序量:
| 文库类型 |
测序平台 |
测序方式 |
建库数 |
样本个数 |
单样本平均数据量 |
数据量单位 |
| 真核转录组文库 |
illumina |
PE150 |
230 |
230 |
6.000 |
Graw data |
注:各样本的raw data不低于承诺平均raw data的98%。
2.微生物样本信息及测序内容
1)样本来源: 冷杉内生菌 ;
2)样本形式: 组织样品 ;
3)样本数量: 205 ;
4)提供实验样本的相关详细资料信息(请注意送样样本命名规范,样本名称必须以英文字母开头,命名支持英文字母、数字、下划线,不可使用空格、中划线或NA、NULL等字符);
5)乙方对甲方的实验样本进行检测,确认样本符合要求后开展实验
6)完成 205 个样本 DNA 提取;
7)完成 0 个cDNA的合成(仅限抽提类型为RNA的样本填写);
8)完成 205 个样本的质检;
9)设计 205 个样本PCR扩增引物以及tag序列,引物选择如下:
| 引物名称 |
引物类型 |
F端序列 |
R端序列 |
长度 |
| 799F_1193R |
植物内生细菌 |
GTGCCAGCMGCCGCGG |
GGACTACNVGGGTWTCTAAT |
291 |
| ITS1F_ITS2R |
真菌ITS |
CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA |
GCTGCGTTCTTCATCGATGC |
350 |
备注:请确保所使用引物扩增产物长度在300-500bp以内;
10)有扩增条件要求,甲方提供PCR条件如下:
| 引物名称 |
样本个数 |
最低单样本数据量 |
单位 |
平均单样本数据量约 |
单位 |
测序方式 |
| 799F_1193R |
205 |
40000 |
clean reads |
50000 |
clean reads |
PE300 |
| ITS1F_ITS2R |
205 |
40000 |
clean reads |
50000 |
clean reads |
PE300 |
11)完成 205 个制备PCR扩增和纯化;
12)使用Picogreen染料荧光计对 205 个PCR产物进行定量并均一化混匀;
13)完成 205 个PCR产物的测序(需保证PCR产物大小在300-500bp之间):
3.基因组测序样品信息及测序内容
1)样本来源: 心腐病菌;
2)样本形式: 组织样品 ;
3)样品数量: 15 个;
4)基因组大小估计为: 未知 Mb;
5)GC含量估计为: 未知 %;
6)是否存在质粒或噬菌体及数量:未知
7)是否菌鉴:是,菌鉴样品数:15
8)完成 15 个实验样品基因组DNA的提取和纯化;
9)完成 15 个实验样品基因组DNA质检和定量;
10) 完成以下表格要求的文库构建和测序量
| 文库类型 |
测序方式 |
建库数 |
样本个数 |
单样本数据量/测序深度 |
数据量单位 |
| PE-400文库 |
PE150 |
15 |
15 |
1.000 |
G raw data |
| Pacbio文库 |
Pacbio |
15 |
15 |
30X |
hifireads-base |
备注:①各样本的数据量(clean data) 不低于合同约定的单样本平均数据量(clean data) 的95%
②包Lane测序只保证总数据量,不保证各样本均达到平均测序量。
二、供应商要求
为保证测序质量,对供应商作如下要求:
1.具有独立法人资格。
2.具有类似项目经验,并有良好的业绩。
3.近3年内在经营活动中没有重大违法记录。
三、报价要求
预算金额16万元以内,各供应商在报价时,务必包含以下内容:
1.检测费用:包括测序、运输等费用。
2.服务费用:包括对数据云平台的使用费用。
四、提交材料
请各供应商在报价时,务必提交以下材料(所有材料加盖公章并密封提交):
1.供应商营业执照副本及税务登记证复印件。
2.法定代表人身份证复印件。
3.检测及售后服务方案。
4.报价单(含单价、总价、数量等)。
五、提交时间及地点
提交时间:2024年11月7日中午12:30分前。
提交地点:****307办公室,线上请联系后投递邮箱****@126.com。
六、其他说明
1.对符合参数要求的报价采取最低价中标的方式确定供应商,并在3个工作日内与供应商签订合同,非中标供应商不再另行通知。
2.合同签订后,供应商应按照合同约定的时间完成样品的检测工作,并保证样本质检合格后开展检测服务,若不合格应及时联系我方进行补样。
3.供应商应遵守国家法律法规,不得进行任何形式的虚假宣传或贿赂行为。如发现供应商存在违法或违规行为,我方有权取消其参与资格或解除合同,并保留追究法律责任的权利。
4.本项目不接受联合体报价。
5.所有提交的文件均应真实有效,一旦发现虚假或伪造资料,将取消其参与资格或解除合同。
联系电话:186****5566。
附件:冷杉心腐病菌多组学联合测序项目清单
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2024年10月31日
附件:
| 冷杉心腐病菌多组学联合测序项目清单 |
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| 序号 |
各项产品 |
单项明细 |
数量 |
单位 |
单价 |
总价 |
备注 |
| 1 |
微生物组学 |
冷杉内生微生物多样性分析 |
205 |
个 |
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| 2 |
转录组学 |
冷杉真核转录组测序 |
230 |
个 |
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| 3 |
基因组学 |
心腐病菌基因组测序 |
15 |
个 |
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| 合计 |
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