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项目编号:****
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项目名称:300例人全基因组高通量测序服务
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采购方式:公开询价邀请询价竞争性谈判竞争性磋商单一来源采购项目比选商品比选
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评审办法: 有效最低价 综合评估法
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项目类型: 技术服务
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预算金额***
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采购单位:***
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联系人:***
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电话:***
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地址:***
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邮箱:***
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300例人全基因组高通量测序服务 品牌:无 货号/型号:无 规格:300例人全基因组高通量测序
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(一)测序平台要求 ★1、投标人应提供具体测序方案和流程,对本项目的检测服务必须采用投标方设备完成,不可外包 2*、投标人应具备固定的测序团队(≥5人)执行测序服务,并保证项目执行过程中与平台相匹配的试剂储备,支持整个项目完成(需提供项目团队人员工作证件); 3*、投****实验室管理体系 (二)测序技术性能指标 1、支持甲方提供全血或DNA。全血提供量200μl~1ml,DNA提供量300ng~1μg,浓度 ≥ 20 ng / ul,OD260 / 280= 1.8~2.2。 2、接受检测合格样本量:接受并检测甲方提供的不少于300例样本的质控和测序分析报告。 3、投标人可在 2 小时内上门交接样本,提供免费冷链运输(保证样本运输过程中质量不受影响); 4、单个样本原始数据产出要求: Raw Data≥90G,Q30≥85%,Duplication rate<10%,单样本平均测序深度≥30x,10×Reads 覆盖率≥90%,测序数据GC 含量 40-45%。 5、建库质量要求 5.1* 核酸起始量要求:能够在核酸起始量≤300ng的情况下,完成样本质检以及建库; 5.2 插入片段检测单峰,分布均匀,且呈标准正态分布; 5.3 测序序列通过比对检查,微生物、载体、叶绿体和线粒体等非测序目标 DNA 污染序列比例<10%; 5.4 测序文库浓度≥2nM,体积≥20ul。 6、数据分析 6.1 原始数据质控评估,去除接头污染和低质量数据的过滤及统计,基因组比对,覆盖度、测序深度分析报告; 6.2* Germline SNV/InDel/CNV/SV 检测,并保存用于 call variants 的 bam 文件,gvcf 文件,提供完整的分析报告; 6.3提供GWAS分析和数据运算服务以及完整的分析方案; (三)检测周期及数据传输、数据存储和交付 1*、一次性完成1000例及以上核酸样本的全基因组高通量测序以及分析,并能够在45个自然日内完成数据/报告交付; 2*、应保证已交付数据存储时长≥1年。供甲方综合评估(投标人须提供书面的数据存储条件和时长的承诺,并盖章); 3、原始数据传输需安全合理,通过硬盘(投标方提供)交付数据)。
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