2025年度采购需求公告（第36批）高通量测序数据深度生物信息学分析服务采购

项目参数如下：

1. 数据预处理

- 原始数据质量控制：评估原始数据的质量。

- 数据过滤：去除低质量 reads、接头序列和污染。

- 数据修剪：修剪低质量碱基和接头序列。

2. 序列比对

- 参考基因组比对：将 reads 比对到参考基因组。

- 比对后处理：包括去重、局部重比对和碱基质量校正。

3. 变异检测

- SNP/InDel 检测：识别单核苷酸变异和小片段插入缺失。

- 结构变异检测：识别大片段插入、缺失、倒位和易位。

- 拷贝数变异检测：识别拷贝数变异（CNV）。

4. 基因表达分析

- 转录组比对：将RNA-seq reads比对到参考基因组。

- 表达定量：使用featureCounts、HTSeq等工具进行基因表达定量。

- 差异表达分析：使用DESeq2、edgeR等工具识别差异表达基因。

5. 功能注释

- 变异注释：使用ANNOVAR、SnpEff等工具对变异进行功能注释。

- 基因功能注释：使用GO、KEGG等数据库进行基因功能富集分析。

6. 高级分析

- 突变特征分析：识别突变特征和模式。

- 网络分析：构建基因或蛋白质互作网络。

7. 数据可视化

- 变异可视化：使用IGV等工具展示变异位点。

- 表达可视化：使用热图、火山图等展示差异表达基因。

8. 报告与交付

- 分析报告：提供详细的分析结果、方法和结论。

- 数据交付：提供原始数据、中间文件和最终结果文件。

9. 定制化服务

- 个性化分析：根据客户需求定制分析流程。

- 数据重分析：对已有数据进行重新分析或深度挖掘。

10. 技术支持与咨询

- 技术支持：提供分析过程中的技术支持。

- 咨询服务：提供数据解读和后续实验设计建议。