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对涡虫组织样本进行翻译组测序分析（WLU-FW-KS-NM-2025-0447）延期公告

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浙江 -杭州

发布时间： 2025年05月06日

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样本测序分析公告

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对涡虫组织样本进行翻译组测序分析	****
2025-04-28 15:25:43	2025-05-09 17:00:00
****	内贸部分：货到验收合格后付全款


￥189800.00





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对涡虫组织样本进行翻译组测序分析

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￥ 189800.00

对涡虫组织样本进行翻译组测序分析：样品提取，质检，分离提取RPF，对RPF进行建库，文库质控，二代测序，对原始数据进行质控及分析。 1、质控指标 - RPFs长度分布，主峰应在28-32 nt。 - rRNA残留率<30%，可通过比对参考基因组评估。 - 文库浓度≥10 nM。 - 片段大小分布Agilent Bioanalyzer检测，主峰符合预期。 2. 测序要求 - 测序平台：Illumina NovaSeq。 - 读长：50-100 bp（覆盖RPFs及接头）。 - 数据量： ≥200 million reads/sample。 - 测序质量：Q30 ≥ 80%。 3. 数据分析与QC (1) 原始数据质控 - FastQC报告：评估测序质量、接头污染、GC含量等。 - 去接头与低质量过滤（使用Cutadapt/Trimmomatic）。 (2) 比对与特异性分析 - 比对参考基因组,使用STAR/HISAT2，提供比对率。 - rRNA/tRNA去除后比对率（目标mRNA占比应≥50%）。 - RPFs周期性分析。 (3) 高级分析（可选） - 翻译效率计算（RPFs vs RNA-seq）。 -差异翻译分析（如RiboDiff、Xtail）。 -新ORF预测（如uORFs、dORFs）。 -根据需求进行多组学关联分析，包括但不限于联合转录组测序、m6A-seq、蛋白组测序，ncRNA等 4. 交付要求 - 原始数据：FASTQ文件（含测序质量报告）。 - 质控报告：RPFs长度分布、rRNA残留率、比对统计、3-nt周期性图等。 - 分析结果： - 比对后的BAM文件。 - 标准化后的RPFs覆盖度文件（如WIG/BedGraph）。 - 差异翻译基因列表（如适用）。 5. 验收标准 - 实验阶段：RPFs长度符合预期，rRNA残留率达标。 - 测序阶段：数据量、Q30、比对率满足要求。 - 分析阶段：3-nt周期性显著，关键质控指标通过。 -完整的分析报告。 6. 交付期限：承诺在样本检测合格后30个自然日内交付。