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| 四倍体泥鳅的全基因组测序和分析服务 | 1.0/1 | 100000.0 | 鱼 | 鱼 | 1.原始数据整理、过滤及质量评估 2.基于PacBio测序数据的基因组组装 3.组装结果统计 4.GC含量分布统计 5.基因组覆盖度统计 6.Hi-C数据比对过滤 7.基于Hi-C互作频率辅助基因组组装 8.构建全基因组互作图谱 9.基于互作图谱的组装结果校正 10.基本基因结构元件预测(CDS、rRNA、tRNA、ncRNA) 11.基因功能注释(NR、COG、KEGG、GO)12.重复序列分析 (组装指标: (1)满足简单基因组条件(杂合度<0.7%,重复序列<50%)情况下,利用Hi-C的数据辅助组装,组装指标:Contig N50达到1Mb,组装到染色体水平的序列覆盖85%的组装基因组。共计挂载四套单倍型,完成四套单倍型的组装和注释) | 1.若甲方验收时发现未达到合同约定的组装指标(如Contig N50<1Mb、染色体挂载率<85%等),乙方需免费重新分析或优化流程直至达标。 2.提供原始数据与结果的交叉验证报告(如Hi-C互作图谱与组装序列的匹配度校验) 3.交付成果中存在遗漏或错误数据(如注释缺失、统计表数值错误),乙方需在3个工作日内完成修正并重新交付。 4.项目原始数据及结果在乙方服务器免费存储至少1年,超期后提前30天通知甲方备份。 5.公司需要有自主测序、分析能力,****公司进行第三方外包。 |