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| 公示项目名称 | 10XGenomics单细胞转录组测序分析 | ||
| 用户单位名称 | **** | 联系人/电话 | 谭**/139****8414 |
| 采购计划预算 | (4300-E23009)转/零A634-2023一流学科群建设子卡-国猪免疫代谢特征形成的机制解析 | 采购计划单号 | SQ****1884 |
| 项目需求 | 本项目旨在通过单细胞转录组测序解析猪胎盘发育或病理状态下的基因调控机制,具体需求如下: 1. 样本设计:共 3个胎盘组织样本(如:妊娠期关键时间点 × 1组 × 3 头母猪,需明确分组依据); 2. 测序要求:采用 Illumina NovaSeq X plus 平台,双端测序(PE150),单样本数据量 ≥100 Gb, 3. 参考基因组:Sscrofa11.1(GRCm38); 4. 生信分析: cellranger:质控、比对; 标准分析:整合样本、降维、聚类、去批次效应、分群、GO和KEGG富集分析; 高级分析:大类注释、亚群细分、差异分析、基因集打分、拟时序分析、转录组因子分析等, 5. 质控标准: (1)样本要求:冻存样本RNA 完整性(RIN≥7.0) (2)核悬液的要求: 细胞活性<5%(台盼蓝染色); 结团率<10%; 建议总量:细胞数> 5 ×10^5; 细胞浓度:700-1200 cells / uL 背景干净,无碎片; 40倍显微镜下,观察核膜完整 (3)数据要求:细胞数≥4000,中位基因数≥500,fraction reads in cells≥70% | ||
| 预算测算依据 | 总预算 ¥32,000–35,000,测算依据如下: 测序分析成本:样本数 × 数据量单价:3 样本 × ¥11000/样(含建库、测序、基础分析与高级分析); 浮动预算:±¥5,000(用于样本重复补充或深度分析调整)。 | ||
| 推荐承办单位名单及承办价格 |
承办单位:****
承办价格:33000.00元
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| 备注 | |||