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项目编号:****
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项目名称:人骨骼肌原代细胞单细胞测序
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采购方式:公开询价邀请询价竞争性谈判竞争性磋商单一来源采购项目比选商品比选
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评审办法: 有效最低价 综合评估法
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项目类型: 技术服务
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预算金额:99000.00元
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采购单位:***
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联系人:***
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电话:***
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地址:***
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邮箱:***
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1
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人骨骼肌原代细胞单细胞测序 品牌:无 货号/型号:无 规格:样本 |
9
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例
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11000.00元
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99000.00元
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一、技术指标 1)样本消化指标 1 . 细胞活性:>85%; 2 . 结团率:<10%; 3. 细胞浓度范围: 700-1200cells/ul; 4. 细胞直径范围:<40um; 5. 有核率: >70%; 2.文库、数据指标 1 . CDNA峰形呈正态分布状,介于500bp-8000bp,主峰1000bp左右; 2 . DNA文库浓度>10ng/ul; 3. 文库测序数据量>100GBase 4. Cellranger分析后的Websummary结果中Q30 Bases in Barcode/ Q30 Bases in RNARead/Q30 Bases in UMl指标>85%; 二、分析内容 1)基本分析 1 . 测序数据质量评估; 2 . Cellranger 细胞分群及差异分析; 3. Seurat 细胞分群及差异分析; 4. 单样本差异基因功能注释和富集、蛋白互 作网络分析、转录因子分析、GSEA 分析; 2)标准分析 1 . 多样本比较( AGGR分析) 2 . 数据整合、识别亚 异表达基因; 3.拟时间序列分析(Monocle):细胞亚群轨迹分析、差异表达分析、基因表达模块分析 3)高级分析 1 .SingleR细胞类型注释分析 2 .整合小提琴图 3. 细胞间互相作用网络 4. 表达基因相关性网络分析 5、WGCNA分析 6、RNA 速率(RNA velocity) 7、SCENIC分析
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三、补充内容 1. 因履行本合同所产生的所有研究成果的相关知识产权归甲方所有。 2. 交付内容:乙方将全部原始数据,分析数据交付甲方。具体成果交付包括单样本提供 10G 以上数据; 原始数据,电子版结题报告、****公司盖章)、结题报告PPT、项目明细;所有电子版的资料移交由两个硬盘备份2次。 2. 提供定制化分析服务(5次以内)。
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