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一个植物材料基因组测序及组装（EJWJ2025233）采购公告

公告-招标公告

福建 -福州

发布时间： 2025年10月28日

摘要信息

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测序采购公告

招标详情

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项目名称项目编号公告开始日期公告截止日期采购单位付款方式联系人联系电话签约时间要求到货时间要求预算总价发票要求含税要求送货要求安装要求收货地址供应商资质要求公告说明

一个植物材料基因组测序及组装	****
2025-10-28 10:41:27	2025-10-31 11:00:00
****	货到验收付款


￥48000.00





符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

采购清单1

采购商品采购数量计量单位所属分类

一个植物材料基因组测序及组装

项

其他自然科学研究和试验开发服务

品牌型号预算单价技术参数及配置要求参考链接售后服务

￥ 48000.00

（1）对样本叶片组织进行DNA提取，构建基因组survey文库，使用DNBSEQ-T7平台，pe150模式进行测序，下机数据量不低于180Gb，Q30≥85%，并利用对所得数据进行基因组survey生信分析；（2）对所提取的样本叶片DNA，构建两个PacBio hifi 20k文库，使用PacBio revio平台进行包芯片测序，每个芯片下机数据量不低于110Gb，并利用所得数据进行基因组组装；（3）对样本叶片组织进行甲醛交联固定，构建两个Hi-C文库，使用DNBSEQ-T7平台，pe150模式进行测序，下机数据量不低于360Gb，Q30≥85%，并利用所得数据进行基因组辅助组装；（4）对样本的根、茎、叶不同组织进行RNA提取，构建1个真核转录组文库，使用DNBSEQ-T7平台，pe150模式进行测序，下机数据量不低于12Gb，Q30≥85%，并利用所得数据进行基因组注释分析；（5）生信分析内容具体如下：分析类型信息分析内容基因组Survey 1. 测序数据质控 1.1 数据质控统计 1.2 测序错误率评估 1.3 A/T/G/C含量分布检查 2. 物种污染评估 2.1 与NT数据库库进行比对 3.K-mer分析 3.1基因组大小预估 3.2 杂合度评估 3.3 重复序列比例评估基因组组装与验证 4. 原始数据质控 4.1 测序数据质控 4.2 HiFi reads统计 5. 基因组组装 5.1 基因组contig组装 5.2 组装序列去杂合（限高杂合基因组） 6. 组装质控评估 6.1 数据回比率评估 6.2 GC碱基覆盖深度评估 6.3 BUSCO完整性评估 Hi-C辅助组装 7. Hi-C测序数据质控 7.1 数据质控统计 7.2 测序错误率评估 7.3 A/T/G/C 含量分布检查 8. 物种污染评估 9. Hi-C辅助组装 9.1 基因组比对 9.2 辅助组装 9.3 准确性评估基因组注释 10. 重复序列注释 10.1 重复序列库构建 10.2 重复序列预测及统计 11. 基因注释 11.1 基因结构注释及统计 11.2 基因功能注释及统计 12. 非编码RNA注释比较基因组分析 13. 基因家族聚类 14. 物种系统发育树构建 15. 物种分化时间分析 16. 基因家族收缩和扩张分析 17. 正选择分析 18. 共线性分析 19. 全基因组复制分析