Somascan P11K蛋白质组学检测服务

C99 其他服务

一、服务项目背景描述 本次测序服务项目能够从单个微量的样本中解锁出前所未有的蛋白质信息维度，以更高效率、更低成本的方式，推动肝脏病学研究及药物研发，是驱动基础科研与临床发现的强大引擎。 二、服务用途描述 本项目拟采用SomaLogic公司授权的SOMAscan11K高通量蛋白质组检测平台，对肝胆系统肿瘤患者血清样本及健康对照人群血清样本进行系统性检测与比较分析。 三、服务要求、标准及配套设备要求 （一）服务要求 1.服务内容 SomaScan 11K蛋白质组学：超10000蛋白质； 1)样本预评估：检查样本状态是否符合要求（溶血、漏液导致不足、标签不清楚或缺失、数量不足等）并反馈样本方； 2)待样本确认后，根据官方实验检测标准流程，完成对样本的Somascan蛋白质组学检测； 3)按照分组要求，完成对Somascan蛋白质组学结果的生信分析并提供生信报告； 4)数据交付: 原始adat文件、生信分析报告（含数据质控）； 2.服务设备： 样本实验平台：Tecan Fluent 芯片检测平台：安捷伦SureScan扫描仪进行扫描，提取荧光图像，并生成原始数据。随后根据Somascan官方的数据处理方法生成质控文件并进行数据校正。 3.生信分析报告内容 1)基础分析（检测总表、PCA分析） 2)差异分析（火山图、HPA数据库注释、聚类分析、多组趋势分析） 3)功能分析（GO\KEGG、GSEA\ssGSEA分析） 4)预后分析（要求每组样本≥30） 5)集成机器学习筛选生物标志物（要求每组样本≥30） 4.质控标准(针对人血清和人血浆) 1) 板间系数范围（Plate Scale Factor）：0.4 - 2.5。 2) Calibrator Percent In Tails（Calibrator样本尾端比例）：Calibrator样本的somamer与参考值的比值超出标准0.6-1.4的比例低于10%。 3) QC Percent In Tails（QC样本尾端比例）：QC样本的somamer与参考值的比值超出标准0.8-1.2的比例低于15%。 4) Calibrator 样本CV中值：5%左右。 5) QC样本 CV中值：5%左右。****公司资质、人员、售后等服务。

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