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| 鸡肌肉组织测序服务 | 458000.00 | 试验周期:6个月 质保期:3年 售后服务要求:针对该项目结果进行个性化分析直到论文发表结束。并且针对这项研究辅助发表1-2篇高质量论文,后期针对以上结果进行专利申请。 售后服务包括通路个性化分析;项目结束后提供用FTP系统交付项目所有原始数据和分析报告(包括高清图表)。 | 项目背景:Capture Hi-C、ATAC-seq 和 CUT Tag 的联合应用,如同一套精密的“组合工具”,能够从一维的蛋白结合与染色质开放状态(CUT Tag, ATAC-seq),推进到三维的染色质空间互作(Capture Hi-C),系统地揭示“蛋白质结合 - 染色质开放 - 三维构象 - 基因表达”这一连贯的调控因果链条,特别适用于精准解析非编码区域的功能、细胞特异的调控网络以及疾病发生发展的深层机制。 总体要求: 1、Capture Hi-C: 对10个鸡组织样品进行特定区域高通量染色体构像捕获(Capture Hi-C),采用illumina测序平台(PE150模式)完成信息采集。 每个样品构建2个Capture Hi-C文库,每个Capture Hi-C文库测序50Gb,即每个样本的总测序量为100Gb Raw data,并完成相应的信息分析。其中,capture hic 用的酶是DpnII,识别GATC。 2、ATAC-seq: 对(基因组大小1Gb)的60个鸡组织样品进行ATAC-seq建库测序,采用二代Illumina测序平台(PE150模式)获得染色质开放区信息。每个样本产生数据量15Gb raw data,并完成相应的信息分析。 3、CUT Tag: 对(基因组大小1Gb)的60个鸡组织样本进行CUT Tag建库测序,采用Illumina测序平台(PE150模式)获得目标蛋白与DNA互作位点信息,每个文库产生的数据量不低于6Gb raw data,并完成相应的信息分析。抗体信息:4种修饰。h3k27ac,h3k27me3,h3k4me1,h3k4me3。构建60个IP+15个IgG文库构建,共75个文库。(igg公司赠送) 4、RNA-seq: 对(基因组大小1 Gb)的60个鸡组织样品进行RNA-seq建库测序,采用二代BGI测序平台获得基因表达信息,每个样品产生6Gb数据量raw data,并完成相应的信息分析。 | 1.0 | 458000.00 | **** |