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600例人重全基因组测序（30X）（FS-BX-250100号）采购公告

公告-招标公告

广东 -深圳

发布时间： 2025年11月03日

摘要信息

招标单位

招标编号

招标估价

招标联系人

招标代理机构

代理联系人

报名截止时间

投标截止时间

关键信息

测序采购公告

招标详情

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相关单位：

***********公司企业信息

项目名称项目编号公告开始日期公告截止日期采购单位付款方式联系人联系电话签约时间要求到货时间要求预算总价发票要求含税要求送货要求安装要求收货地址供应商资质要求公告说明

600例人重全基因组测序（30X）	****
2025-11-03 10:07:07	2025-11-08 12:00:00
****	验收合格后支付100%


￥492000.00





符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

采购清单1

采购商品采购数量计量单位所属分类

600例人重全基因组测序（30X）

600

项

基础医学研究服务

品牌型号预算单价技术参数及配置要求参考链接售后服务

￥ 820.00

1. 服务范围受委托单位须依据委托单位提供的样本（白细胞），完成 DNA 提取、建库及全基因组测序。****实验室须持有 ISO 等国际认证机构颁发的有效资质认证。 2. 样本与 DNA 质控 2.1 受委托单位须对提取的 DNA 样本进行质量控制，并根据质量进行分级。 2.2 须向委托单位提交 DNA 质量检测报告，详述质控结果。 3. 测序数据要求 3.1 每个样本的原始测序数据量须不低于 95 Gb（以核苷酸数计）。 3.2 在样本提取合格的前提下，测序数据须满足以下质量指标： a) Q30 碱基比例 ≥ 85% b) Q20 碱基比例 ≥ 90% c) 数据冗余度（Duplication 率）< 10% 4. 数据质控与重处理 4.1 若样本测序后出现以下情况之一，且原样品有剩余，受委托单位须对指定样本进行免费重提取： a) 原始数据量未达到 95 Gb； b) 发现样本存在污染或降解。 4.2 若重提取后 DNA 质量仍不合格，委托单位可提供备份样品，受委托单位进行提取、建库与测序，并另行收取相应费用。 4.3 因生物信息学质控或样本不合格导致的样本重测，将根据实际使用的服务环节（提取、建库、测序）按约定价格收费，未使用的环节不收费。 4.4 因生物信息学质控不合格导致的单纯加测（仅需补测序），受委托单位须免费执行。 5. 设备与数据安全 5.1 测序服务须使用我国拥有自主知识产权的测序平台。 5.2 自项目启动至项目完成后三个月内，相关测序设备须与互联网物理隔离或保持断网状态。 6. 数据交付与存储 6.1 数据交付须按委托单位指定的方式进行。 6.2 受委托单位须在数据交付后，为委托单位保留数据副本 30 天。如委托单位对数据有疑问，须在 30 天内提出重新拷贝申请。 6.3 项目完成后，剩余的生物样本须返还委托单位。 6.4 受委托单位须根据委托单位的书面要求，彻底删除所有人类遗传**数据（包括但不限于白细胞、DNA 样本、测序数据等），不得以任何形式隐匿或保留。 7. 保密与责任 7.1 受委托单位有义务保障人类遗传**数据安全，严禁向任何非协议相关方泄露。 7.2 未经委托单位书面同意，受委托单位不得将本项目的任何部分分包或转包给第三方。如有违反，视为根本违约，委托单位有权追究其法律责任并要求赔偿损失。 8. 知识产权与后续支持 8.1 本项目所产生的所有测序数据及相关知识产权，归委托单位所有。 8.2 项目进行中或结束后，如委托单位在论文发表、课题申请中需要技术材料，受委托单位有义务提供必要的配合与撰写支持。 9. 生物信息学分析流程受委托单位须按照 GATK 标准流程对每个样本的 fastq 文件进行处理，生成可用于联合变异检测（joint calling）的 gVCF 文件，并完成以下分析与交付： 9.1 数据预处理：去除接头序列和低质量数据，并提供每个样本的 Q20、Q30 数据。 9.2 序列比对与覆盖度分析：使用 BWA 软件将序列比对至 hg38 参考基因组，并提供以下指标： a) 每个样本的全基因组、常染色体组、X 染色体、Y 染色体的平均测序深度； b) 全基因组范围测序深度达到 10×、5×、1×的覆盖比例（需排除重复序列和未定位/随机染色体区域）。 9.3 提供每个样本的比对率（mapping rate）、错配率（mismatch rate）、GC 含量及重复序列率。 9.4 提供联合变异检测后生成的 X、Y 染色体 VCF 文件（包含 SNV 和 Indel），供委托单位进行质控与样本筛选。 10. 群体遗传学质控评估样本是否存在人源污染、微生物污染，并分析个体间亲缘关系，形成专项报告。 11. 最终变异检测与数据交付 11.1 委托单位在获取上述数据并进行样本筛选后，将指定最终样本列表与分析参数，受委托单位须据此完成联合变异检测（含 VQSR 步骤）。 11.2 最终交付物须包括： a) 每个样本的 fastq 压缩文件、BAM 文件、gVCF 压缩文件（含 SNV 和 Indel），以及 VQSR前、后的 VCF 压缩文件（含 SNV 和 Indel）。 b) 详细的质量控制参数与完整分析流程文档。 c) 每个样本的所有数据须独立存放于以样本名命名的文件夹中。 d) 提供所有交付文件的 MD5 校验码。 11.3 委托单位在接收数据时，将出具书面接收证明。