杭州市疾病预防控制中心（杭州市卫生监督所）关于结核分枝杆菌菌株全基因组委托测序项目招标公告

根据《****政府采购法》等有关规定，****就结核分枝杆菌菌株全基因组委托测序项目进行招标。

一、项目名称：

结核分枝杆菌菌株全基因组委托测序项目

二、项目编号：****

三、采购方式：竞争性磋商

四、经费预算：120000.00元

五、供应商资质要求

（一）基本条件：

符合《****政府采购法》第二十二条第一款的规定：

1. 具有独立承担民事责任的能力；

2. 具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度；

3. 具有履行合同所必需的专业技术能力；

4. 有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录；

5. 参加政府采购活动前三年内，在经营活动中没有重大违法记录；

6. 法律、行政法规规定的其他条件。

（二）特定条件：无。

（三）供应商是指向采购人提供服务的法人或者其他组织。

六、采购内容要求

技术要求：

1、二代测序：

1)核酸提取：提供对灭活后的结核分枝杆菌样本基因组提取服务，同时对基因组进行质检，并提供样本基因组质检报告；

2)文库类型：350bp小片段文库；

3)测序平台：Illumina测序平台；

4)测序策略：PE150；

5)测序深度：200X；

6)测序覆盖度：＞99%；

7)测序数据量：≥1G/样本；

8)原始下机数据测序质量要求：平均Q20≥90%，平均Q30≥85%；

9)低质量序列过滤、接头（adapter）序列去除：原始数据(Raw Data)进行去除接头和低质量read的处理，得到有效数据(Clean Data)；

10)交付形式：raw data 和clean data，供应商提供移动硬盘进行数据交付。

11)交付周期：分批次送样，收到样本后12个工作日内完成。

2、分析要求：

基础分析：

1)基因组组装和质控统计；

2)基因组组分分析：编码基因、非编码RNA、前噬菌体、整合子、插入序列、基因岛、CRISPR-Cas；

3)基因功能注释：GO、KEGG、COG、NCBI Taxonomy；

4)病原细菌致病性和耐药性分析：细菌致病菌毒力因子（VFDB）注释、耐药基因（CARD）注释、分泌蛋白预测。

结核分枝杆菌定制化分析：

1)菌种鉴定：识别结核分枝杆菌（MTBC）或非结核分枝杆菌（NTM），可识别的NTM种数不少于175种。

2)比较基因组分析：SNP/InDel变异检测及注释；

3)谱系鉴定：基于变异检测结果的谱系鉴定；

4)耐药性分析：基于变异检测结果的耐药预测，包含所有一线药物和部分二线药物，共计21种药物；

5)群体进化分析：

a)遗传距离分析（近期传播关系鉴定）

b)群体进化树分析

6)混合感染鉴定；

7)*开展包含8个主要谱系的泛基因组图谱参考序列为参考的菌株间距离计算、近期传播探测和分子网络构建，需提供相关发明专利证书及参考序列作为证明。

3、商务要求：

1)供应商具有良好的适****实验室设施及环境，并具备严格的质量管理体系。

2)在结核分枝杆菌研究领域有专业科研团队，具备扎实科研能力，需提供JCR 一区的SCI一作（包括共同一作）/共同通讯发表相关论文佐证。

3)*在**省具有独立的实验平台、技术团队及售后服务网点，售后响应时间不超过8小时，且具备上门取样、技术分析讨论等条件。

4)*供应商需免费提供本单位样本的物流配送服务，供应商需具备冷链运输服务能力，提供道路运输经营许可证、医疗器械经营许可证、第二类医疗器械经营备案凭证、冷藏车验证报告、GPS监控与温度控制过程相关证明，并且具备检验标本运输车辆，需提供样本运输车辆行驶证。不支持转包服务。

5)*供应商需具备至少1名实验人员，****实验室生物安全上岗证，硕士及以上学历，需提供实验员近6个月社保、学历学位专业证书、实验室生物安全上岗证等。

6)*供应商需具备至少2名生物信息学专业博士以支持后续分析研究，需提供近6个月社保、学历学位专业证书等。

7)供应商需提供相应的数据存储及信息安全保障措施及方案。

七、成交供应商的确定：本次采用综合评标法。标书代写

八、评分标准：见附件

九、其他说明

1.投标单位请于2025年11月24日09:30前将书面报价文件[正本1份、副本3份，盖公章标书PDF格式电子版U盘/光盘储存并密封1份，标书外封面留联系电话；另提供营业执照、经营许可证复印件并加盖公章、授权委托书、被授权委托人须提供本人有效身份证明]胶装密封送达地址：**市上**明石路568号****2号楼4层综合保障科，送达后领取磋商最终报价表（投标文件不符合以上要求无效）。标书代写

2.书面报价文件（投标提交后不得更改）由****审核小组进行审核，在符合招标资质要求的前提下，以综合得分最高者成交。

3.招标单位与中标单位协商确定合同内容，按合同履行。

4.联系人：王先生

地址：**市上**明石路568号****2号楼4层综合保障科

联系电话（传真）：0571-****1273

监督电话：0571-****0532

附件：结核分枝杆菌全基因组测序项目打分表.docx

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2025年11月18日