【采购公告】 生物样本的多组学测序分析

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生物样本的多组学测序分析

品牌：无

货号/型号：无

规格：24例单细胞转录组、12例单细胞ATAC、20个Bulk转录组测序

主要技术指标： 1.样本兼容性：支持实验动物（如小鼠、大鼠等）多种组织样本（如肝脏、肾脏、脑组织/肺组织等）检测。 2.单细胞转录组核心指标：每个样本有效细胞数≥5000个，测序深度≥30000 reads/细胞，基因组比对率≥92%，基因检出数≥1000个/细胞。 3.单细胞ATAC核心指标：每个样本有效细胞数≥5000个，转座位点位于peaks区域的比例（Fraction of high-quality fragments overlapping peaks）≥15%，基因组比对率≥80%，转录起始位点的标准化分数（TSS enrichment score）≥3，有效barcode的reads的比例（Valid Barcode）≥75%，每个细胞中fragments的中位值（Median fragments per cell）≥4000。 4.Bulk转录组核心指标：每个样本测序数据量≥5Gb，基因组比对率≥90%，无明显接头污染及核糖体RNA残留（≤2%） 5.文库测序：所有文库主带清晰，无明显降解，片段大小符合对应测序类型要求（单细胞转录组200-500bp、单细胞ATAC 300-600bp、bulk转录组200-500bp）；测序策略为PE150，Q30≥90%。 6.分析服务：提供数据预处理（过滤、比对、定量）、质控报告、细胞分群（单细胞项目）、差异基因/峰分析、功能富集分析（GO/KEGG）、调控网络分析等。 配置要求： 1.针对不同组织类型做解离方案优化。 2.单细胞上机仪器使用10x Chromium X，单细胞转录组试剂使用GEM-X，单细胞ATAC试剂使用Epi ATAC。 3.测序过程中，测序仪使用Illumina NovaSeq X Plus/Illumina NovaSeq 6000。 4.利用10x Genomics官方分析软件Cell Ranger对原始数据进行数据过滤、比对、定量、鉴定回收细胞，得到各细胞的基因表达矩阵,并采用Seurat进行细胞过滤、标准化、细胞亚群分类、各亚群差异表达基因分析及Marker基因筛选。 5.提供bulk转录组、单细胞转录组线上分析平台。 6.每个样本的数据量为100G提供个性化数据分析服务及人工售后服务。