询价公告——基于多模态深度学习预测儿童神经发育迟缓风险的研究蛋白组学分析服务项目

发布时间: 2026年02月06日
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询价公告——《基于多模态深度学习预测儿童神经发育迟缓风险的研究》蛋白组学分析服务项目

各供应商:

为开展,需要进行蛋白组学分析服务,现进行询价,相关事项公告如下:

一、项目概况

1、项目名称:《基于多模态深度学习预测儿童神经发育迟缓风险的研究》

2、计划时间安排:2026年01月至2026年02月,具体以实际项目进行情况为准。

二、经费预算

预算控制金额35000元。预计63份,按实际份数结算。

三、项目服务内容及要求

1.样本质控

观察提取样品外观,样品量充足、外观无异常的可进入后续样本制备环节。

2.全蛋白提取

从-80℃冰箱取出组织样品,低温研磨成粉,迅速转移至液氮预冷的离心管,加入适量的SDT(含100 mM Nacl)和与体积对应1/100的DTT溶解,振荡混匀,冰水浴超声5 min 充分裂解。于4℃、12000 g离心15 min,取上清95℃反应8-15 min,冰浴2 min,加入足量 IAM溶液,放置在黑暗条件下反应1 h。加入4倍体积的-20℃预冷丙酮于-20℃条件下沉淀至少30 min,于4℃、12000 g离心15 min,收集沉淀。之后加入1 mL -20℃预冷丙酮重悬并清洗沉淀,收集沉淀,风干,沉淀即总蛋白。加入适量Dissolved Buffer ( DB buffer ),彻底溶解蛋白沉淀。

2.蛋白检测及质控

对蛋白质样品的检测内容主要包括蛋白浓度、蛋白总量、蛋白降解、样品间蛋白分布均一性良好等,涉及检测技术为蛋白质定量和SDS-PAGE,具体检测过程如下:

使用Bradford蛋白质定量试剂盒,按照说明书配制BSA标准蛋白溶液,浓度梯度范围为0-0.5 μg/μL。分别取不同浓度梯度的BSA标准蛋白溶液及不同稀释倍数的待测样品溶液加入96孔板中,补足体积至20 μL,每个梯度重复3次。迅速加入180 μL G250染色液,室温放置5 min,测定595 nm吸光度。计算标准品及样品平均值并减去各自的背景值得到标准品及样品的校正值,以标准品校正值对浓度绘制标准曲线,代入标准曲线的拟合公式计算待测样品的蛋白浓度。各取20 μg蛋白待测样品进行12% SDS-PAGE凝胶电泳,其中浓缩胶电泳条件为80 V、20 min,分离胶电泳条件为120 V、90 min。电泳结束后进行考马斯亮蓝R-250染色,脱色至条带清晰。

3.蛋白酶解

取蛋白样品,加入DB蛋白溶解液(6 M尿素、100 mM TEAB,pH=8.5)补足体积至 100 μL,加入胰酶和100 mM TEAB缓冲液,混匀后于37°C酶切4 h。加入甲酸调节pH小 于3,混匀后于室温、12000 g离心5 min,取上清缓慢通过C18除盐柱,之后使用清洗液 (0.1%甲酸、3%乙腈)连续清洗3次,再加入适量洗脱液(0.1%甲酸、70%乙腈),收集滤 液,冻干。

4.Orbitrap:Astral DIA模式液质检测

配制流动相A液(100%水、0.1%甲酸)和B液(80%乙腈、0.1%甲酸)。使用10 μL A液溶解冻干粉末,4℃下14000 g离心20 min,取上清200 ng样品进样,液质检测。使用Vanquish Neo纳升级UHPLC系统,C18预柱为174500(5 mm×300 μm, 5 μm,thermo),50℃柱温箱加热,C18分析柱为ES906(PepMap TM Neo UHPLC 150 μm x 15 cm,2 μm,thermo),液相色谱洗脱条件如表1所示,使用Thermo orbitrap astral mass spectrometer质谱仪,Easy-spray(ESI)离子源,设定离子喷雾电压为1.9kV,离子传输管温度为290℃,质谱采用数据依赖型采集模式,一级质谱全扫描范围为m/z 380-980,一级质谱分辨率设为240000(200 m/z),AGC设置500%,母离子窗口大小设置2-Th,DIA窗口数是300个,NCE设置25%,二级m/z采集范围是150到2000,子离子分辨率Astral设置80000,最大注入时间是3ms。成质谱检测原始数据(.raw)。

流程分析思路图

1

服务内容

蛋白定量质谱检测

2

检测平台

Orbitrap Astral质谱仪

3

样本类型

63例样本

4

分析内容

蛋白质鉴定

1. 对原始数据(.raw)使用Spectronaut 18或DIA NN(Direct DIA)搜库软件进行数据库检索,得到蛋白质信息,进行蛋白鉴定。

数据质控

2. 搜库完成后,对数据进行质控

2.1 肽段长度分布

2.2 iRT的检出率

2.3 Unique肽段数分布

定量分析

3. 蛋白质定量结果

3.1定量结果统计(总差异蛋白数、上/下调数量)

3.2 PCA分析

3.3重复性分析

3.4火山图分布

3.5检出蛋白层次聚类分析

3.6检出蛋白K-means聚类分析

3.7差异蛋白层次聚类分析(有生物学重复样品)

3.8差异蛋白K-means聚类分析

3.9蛋白表达趋势聚类(Mfuzzy)分析

重复性分析

4. 定量结果重复性分析(有生物学重复样品)

蛋白功能分析

5. 蛋白质功能注释

5.1 总蛋白功能注释

5.1.1 总蛋白GO功能注释(韦恩图分析)

5.1.2 总蛋白COG功能注释

5.1.3 总蛋白KEGG功能注释

5.1.4 总蛋白结构域注释

5.1.5 亚细胞结构定位分析

5.1.6转录因子注释结果条形图

5.2差异蛋白富集分析

5.2.1 GO富集分析

5.2.2 KEGG富集分析

5.2.3结构域富集分析

5.2.4差异蛋白亚细胞定位分析

5.3 GSEA分析

5.3.1 GSEA-GO分析

5.3.2 GSEA-KEGG分析

5.3.3 GSEA-IPR分析

5.3.4 GSEA-亚细胞定位分析

5.4 差异蛋白质互相作用网络图

四、项目后期服务内容

1 技术支持服务

为采购人提供7×6小时免费电话咨询服务,并安排指定客服工程师与采购人联系。当样品选择、数据解读等方面出现存疑时,投标人需在收到相关邮件或电话后于24小时内进行解决。

1.1 电话支持

会对招标方提供长期的电话支持服务。服务时间为7 24小时,在周一至周五的上班时间(8:30 – 17:00)可以拨打热线电话。在其余时间可以通过手机与当地销售人员联系。供应方在接到技术支持请求或需要帮助报告后,需在2小时内响应客户建议,并以电话方式同采购方取得联系,了解其所需的服务内容,以提供相应帮助和解答。

对于后续在样品处理、样品邮寄、数据释放以及相关的中间环节及售后环节,都会有专业的销售或技术人员帮忙解答和处理。

1.2 现场服务

供应方要保证该项目由专人负责,负责的销售人员及技术人员将经常与单位的相关人员一起,督促整个项目的顺利进行,及时地发现问题、解决问题,及时沟通,确保项目样品安全、项目周期;并能承诺到招标单位进行定期回访,提供技术人员现场解决处理项目售后问题。

供应方要根据招标方确定的项目特点,与业主项目负责人共同设计并修订计划和具体实施方案。供应方需要完成过多个大数据项目的分析工作,拥有丰富的信息分析经验。项目启动前,事业部项目团队将与采购方共同进行方案的讨论与策略的制定。项目启动后,根据采购方需求,技术人员可对采购方作现场指导或问题解答,为采购方讲解建库测序项目进行中各部分原理及操作流程。

1.3 服务响应

若分析测试或采购人在使用过程中出现技术问题,供应方接到采购单位通知后,24小时内进行解决,费用由供应方承担。

2数据传输及保存服务

2.1 数据传输及保存服务

供应方会向招标方提交结题报告,说明项目完成情况,测序过程中产生的序列文件*.fq(或*.fa)和相关的生物信息分析结果文件。如果数据量小于50G,供应方将使用FTP服务器供采购方下载,如采购方因网络等原因无法顺利下载,供应方可提供移动硬盘传输,以最快方式向采购方返回数据,同时返回当批次文库构建与测序实验的质控报告。

测序数据所有权和使用权为采购方独有。供应方在向采购方提供最终数据后,对数据的存储时间为3个月,若采购方未在届满前10日书面提出继续需保存数据,将在届满期后删除。如果采购方在届满期前10日书面提出继续保存数据,则需签订补充协议,并根据实际储存数据量与存储时间进行计费。

2.2 项目验收程序

为使测序服务项目按照标准要求进行,确保项目结题后达到招标文件要求和标准,并能正常投入后期实验要求,供应方需承诺按招标文件相关要求协助招标方进行项目验收。

招标方组织相关人员对项目进行验收需求分析,针对项目验收编制验收方案。****小组严格按照项目验收方案进行全面的测试与验收。项目验收完毕,对项目实验设计、建库质量、文库质量、测序质量情况等做出全面的评价,得出结论性意见,对不合格的项目不予验收,对一切问题提出具体的解决意见。验收期间供应方需全****小组工作,及时提供验收相关材料,并保证材料的真实性。

2.3 售后服务网点

技术支持和客户经理可提供全面的售后服务。

2.4 培训方案

2.4.1 培训支持目的

为使采购方在使用产品及服务时得到必要的技术支持,供应方需满足采购方测序服务数据解读需求,并及时解决采购方在产品及服务使用过程中所遇到的问题,并派项目相关人员进行定期回访、培训。

2.4.2 培训权责

业务线根据项目进展情况以及采购方对产品的需求情况,自主安排对外采购方培训。

2.4.3 培训对象

采购方。

2.4.4 培训次数及培训地点

次数:根据采购方实际需求;地点:采购方所在单位。

2.4.5 培训形式及培训内容

培训内容以与项目相关的各模块产品知识以及数据分析结果解读为主,以便更好地解决在线项目问题,同时提高采购方技术水平。培训模式分为以下两种:

技术人员到采购方所在地进行指导或培训

(1)项目启动后根据采购方需求,6小时之内响应,技术人员可对采购方作现场指导或问题解答;

(2)事业部项目团队与采购方共同进行方案的讨论与策略的制定;

(3)另外,可根据采购方需求,选派专业讲师,在采购方所在单位开展培训工作,为采购方讲解项目进行中各部分原理及操作流程,及数据解读。

网络培训,采购方自助式进行产品模块知识学习

(1)向采购方提供项目各个模块学习资料和在线答疑咨询服务;学习资料包括各个模块基本原理及操作、常见问题解答以及相关术语介绍,为采购方提供快速、简洁、方便的培训服务;

(2)对于项目分析进展,每周反馈,对于结题报告、数据,采用音频或者视频的方式进行解读,使采购方足不出户就能实时跟进项目进展。

五、质量保障措施及方案:

供应方需建设有目前最先进的蛋白质组质谱检测平台及代谢组质谱检测平台,2套Orbitrap Astral 高分辨质谱仪、9套Q ExactiveTM HF-X、3套Q ExactiveTM HF、1套Exploris 480、1套布鲁克timsTOF pro2、5套AB SCIEX QTRAP 6500、5台VanquishTM UHPLC、4台EASY-nLCTM 1200 UHPLC等最先进的仪器,并建设有全球领先的高通量测序平台。供应方需完全有实力和能力确保此项目周期。项目启动后,供应方要定期向招标方发送项目进展情况一览表,并汇报阶段进展及下一部分分析计划。项目执行每个阶段均整理撰写阶段性报告,并交由招标方确认,由招标方监督项目进展。每月进行一次当月样品进行汇总反馈,项目进行中任何问题随时沟通。

(一)质保方案

供应方需对本次服务执行国家(或同等或更优的行业)相关标准,对招标人提供的多例样本进行蛋白质提取和质量检测,提供的多例样本进行代谢物提取和质量检测,以保证蛋白质和代谢物得质量并提供质量检测报告,且所有样品均按标准进行上机检测,并完成蛋白质和代谢物基础生信分析的服务。并提供前期样品采集技术支持,提供数据后期分析技术支持。

1)样品标识

供应方要将样品名称等各种信息写在标签纸上,贴在管壁,外面再用透明胶带缠绕一圈(一方面防止样品名称被泄露的有机溶剂溶掉,另一方面也可以防止标签纸没有粘牢脱落,导致样品无法识别),胶带尽量紧贴管壁,避免褶皱影响样品信息的准确。邮寄样品时,供应方要提供标准格式的样品信息单(电子版、纸质版),并仔细检查,务必保证信息单中填写的样品名称、数量与实际邮寄的样品名称标识、样品数量完全一致。

2)样品运输条件

本次招标样本,应放于干冰中运输;运输过程中添加足量的干冰,且干冰维持量为5 kg/day。

供应方在接收到样品后,要给样本进行统一编号,使每个样本都有一个唯一的ID。在生产流程中,供应方要根据样本编号进行生产,剩余样本保存于-80 ℃冰箱。

3)记录样本信息

供应方要提供每个样本的首次上机测序日期、批次,首次测序反应成功和失败的记录(记录信息包括但不限于日期、生产批次等),以及测序失败样本复测、加测时的生产记录等信息。

(二)紧急预案

1)若在实验过程或数据处理中遇到技术障碍,供应方应与招标方及时沟通,双方沟通时间及处理障碍的时间应从合同规定的周期中扣除。

2)如遇到机器故障等人力不可抗拒及不可预知的情况发生时,为确保招标方项目周期,供应方要相应提高项目优先级,安排骨干力量组织项目提前安排相关实验,提前上机,以确保整个项目的周期及数据质量。

3)若招标方有需加急项目,供应方应根据实际情况,告知可比合同规定缩短的周期天数,并在首付款60%到账前开展样品检测服务,首款到账后扣取合同规定的样品检测费用。

六、服务期限

1)服务期限:自合同生效之日起三年(特殊情况以签订合同为准)。

2)此项目周期从建库开始到最终结题在30个自然日交付。后续个性化分析服务,自项目交付后,一直服务到甲方文章发表为止。

七、保密措施

1)保密内容(包括技术信息和经营信息):原始资料、技术路线、试验报告及与试验有关的资料结果及价格等。

2)涉密人员范围:参与项目所有人员。

3)保密期限:自合同生效日起2年。

4)泄密责任:一切责任由泄密方承担。

八、供应方资格要求

(一)供应方须具有独立承担民事责任的能力,严禁任何单****公司证照参与报价;

(二)供应方须具有包括但不限于经营本询价文件所述服务内容的资质;

(三)报价人及服务团队成员有良好的社会信誉和诚信记录,3年内未受到行业行政主管部门的行政处罚等不良记录,需作出相关书面承诺;

(四)报价人与询价人无利益冲突;

(五)法律、行政法规规定的其他条件。

九、报价要求

(一)报价人报价不得更改,报价包含服务期间所可能发生的一切费用,采购方不再支付其他任何费用。一旦成交,采购人将不会对其报价做出其他补偿;

(二)报价应包含完成本项目的所有费用,报价人漏报、少报的费用,视为此项费用已隐含在报价中,成交后不得再向采购人收取任何费用;

(三)除另有规定外,若出现有关法律、法规和规章有强制性规定但询价文件未列明的情形,则报价人应按照有关法律、法规和规章强制性规定执行;

九、报价文件组成

报价文件采用密封纸质文件递送,报价文件需含以下内容:

(一)营业执照复印件;

(二)法人身份证复印件、若有授权代表请提供身份证复印件及授权委托书;

(四)报价单,需包含项目单价及总价;

(五)无不良记录书面承诺。

以上文件加盖公章,装订成册并加盖骑缝章,一式壹份,用文件袋包装并在文件袋封口处加盖公章密封或由授权代表签字密封,****公司全称、联系人及联系电话,邮寄或现场送达。

收货地址:**市**区**路92-98号门诊五楼保障保卫部

联系电话:陈老师(收)0592-****658

项目响应文件送达截止时间2026年2月9日17:00前,逾期送达的或不符合规定的响应文件将被拒绝。加急标书代写

十、评价办法

满足科室基本需求的基础上,按照最低价中标的方法确定成交供应商。

十一、付款方式

****医院签订合同。在合同规定的时间内,承包商完成项目,经采购人确认后,承包商开具发票,采购人报销后支付合同款给承包商。

反馈电话:保障保卫部 陈老师0592-****658

实验室:180****9291

监督科室:监察审计室 0592-****235

****医院

****

2026年2月4日

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2026-02-06
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