外送测序服务采购征询会公告

发布时间: 2026年05月20日
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参照《**市医疗设备器械采购内控工作监督管理办法(试行)》的具体要求,现对****拟采购的外送测序服务项目进行公开询价。本次公开征询情况将作为采购人的采购依据,欢迎广大符合要求的生产企业及经营企业积极参与。现将有关事项公告如下:

一、采购项目及需求

二、公告时间

2026年5月20日—2026年5月27日

三、报名时间、地点及方式

1.时间:2026年5月27日17时前

2.地点:****综合业务大楼818室

3.报名方式:

(1)现场报名,同时递交法人授权委托书、参询代表身份证复印件等材料及联系电话。

(2)外地参询企业可以电话报名,相关印证材料邮寄或电子版发送。邮箱:****@126.com

4.联系人及联系方式:张女士 0793-****107

5.所有符合报名条件的机构均可参加报名,采购人不得以任何理由拒绝。

6.监督电话:

0793-****781 ****办公室

0793-****261****纪委****卫健委纪检监察组

四、价格征询会时间、地点

时间:(具体时间另行通知)

地点:****综合业务大楼905室

五、参询单位需提供的相关材料

1.投标人须提供如下承诺函原件:

1.1具有独立承担民事责任能力的合法供应商;

1.2 具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度;

1.3具有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录;

1.4近三年内在经营活动中没有重大违法记录;

1.5具备履行合同所必需的设备和专业技术能力的证明材料;

1.6具备法律、行政法规规定的其他条件;

1.7参加此次活动前三年内,供应商单位及其现任法定代表人、主要负责人不得具有行贿犯罪记录。

1.8参询资料真实性承诺函。

2.询价品目报价表(自拟)。

3.参询企业的资质证明材料:

3.1营业执照(三证合一证)复印件;

3.2法人授权委托书、参询代表身份证复印件;

3.3经认证的生物安全Ⅱ级(BSL-2)实验室资****实验室资质(提供执业许可证明文件)。

参询材料分开装订,一正两副共三份加盖参询单位公章,参询方在参加征询会时现场递交。

六、参询文件编制的注意事项

1.1参询单位应认真、仔细阅读征询公告中所有的事项、格式、条款和规范等要求。

1.2参询人应以无线胶装的形式按参询文件的格式要求按顺序编制目录及页码装订成册,否则材料丢失引起的后果自负。

1.3参询文件分为正、副本,副本可为正本的复印件。

1.4参询文件及往来函件均须用中文书写。

1.5参询人应按要求,规范、明确、准时地提交参询材料。如果没有按照征询公告要求提交全部资料并保证所提供全部资料的真实性,其风险由参询方自行承担。

七、价格征询

1.1价格征询会由********小组指定人员主持,邀请所有参询方、专家组成员参加,纪检监察部门对征询会全过程进行监督,参询方的代表人员应签到以证明其出席。

1.2 在纪检监察部门监督下,从专家库随机抽取2名医疗专家、1名医学装备专家共计3名专家组成临时专家组,并由专家组成员推荐一名专家为此次价格征询会专家组组长。

1.3 价格征询应做好记录。

八、评审原则与标准

1.1 征询公告、参询材料及相关的法律法规为评审依据。

1.2 科学评估、集体决策,体现公开、公平、公正。

1.3最低评标价法:投标(响应)文件满足询价文件全部实质性要求,且报价最低的供应商为中标(成交)候选人。标书代写

****

2026年5月20日



附件:主要技术指标(基本配置和功能要求)


一、二代细菌全基因框架图测序

1.文库构建: 构建好的文库后进行质量和产量的检测。

2.测序策略及质控:

2.1 PE150及以**通量测序;

2.2 高质量的下机数据≥1G;

2.3基因组覆盖度≥95%;

2.4基因区覆盖度≥98%,整体覆盖深度≥100×;

2.5碱基数据质量值Q30比例≥90%;

2.6组装结果contig数量≤200个;

2.7 对组装结果进行物种注释;

2.8 满足国家致病菌识别网监测工作要求;

2.9 根据客户需求,可提供个性化分析,**耐药基因预测、毒力基因预测、血清型预测、mlst分析、SNP进化树分析。



二、国家致病菌识别网标本二代宏基因组测序

1.服务内容:宏基因组测序:对微生物环境样本进行二代高通量测序及后续的数据质控,交付完整原始数据并进行宏基因组分析。

2.服务要求:

2.1服务方应对检测内容进行预实验,我中心对预实验结果进行质量复核。

2.2应对核酸进行浓度、纯度检测,测序策略:双端测序,PE150起。

2.3服务方应采用高通量测序技术进行建库测序,每个样品产生的平均原始数据不应低于rawdata数据量:≥10G;

2.4rawdata质量:PE150、PE250及以上测序,Q30以上占比≥85%,Q20以上占比≥90%

2.5数据分析内容:Rawdata过滤原则:去接头序列,去掉平均质量低于20的reads,去除含连续5个及以上N的reads,去宿主序列。

2.5.1数据质控(低质量reads过滤、adaptor过滤、宿主过滤)

2.5.2基因组组装。

2.5.3基因预测、去冗余。

2.5.4基因丰度统计:样本基因数目统计、core-pan基因稀释曲线、基因数目差异分析(组间基因数目差异箱图、Venn图/花瓣图)、基因数目的样品间相关性分析。

2.5.5物种注释及统计:物种丰度概况、注释基因数目及相对丰度聚类分析、基于物种丰度的降维分析、基于物种丰度的。Bray-Curtis距离的降维分析、基于物种丰度的Anosim分析、基于物种丰度的样品聚类分析、组间差异物种的 Metastats分析、组间差异物种的LEfSe分析、随机森林分析。

2.5.6功能注释及统计:KEGG、eggNOG、CAZy。

2.5.7功能丰度统计:功能相对丰度概况、功能相对丰度聚类分析、基于功能丰度的降维分析、基于功能丰度的Bray-Curtis距离的降维分析、基于功能丰度的Anosim分析、基于功能丰度的样品聚类分析。

2.5.8代谢通路比较分析:代谢通路比较分析、代谢通路注释基因数目及差异EC分析。

2.5.9组间功能差异的Metastats分析、组间功能差异的LEfSe分析。

2.5.10抗性基因注释:抗性基因丰度概况、抗性基因类型的分布及丰度聚类分析、组间抗性基因数目差异分析、抗性基因与物种归属关系。

三、二代常规病毒全基因组测序

1.覆盖所有不同型别的诺如病毒(包含但不限于GI,GII,GIV型),轮状病毒(包含但不限于A、B、C、H组)等全基因组测序,病原体测序及生信分析报告周期约15个工作日;

2.针对背景复杂的原始标本,在测序前采用自主研发的富集处理技术对靶基因进行富集,提高测序成功率,可覆盖多种类型的病毒病原体;

3.针对原始样本,对宿主核酸进行处理,确保下机数据中宿主基因含量<60%;对原始标本测序前采取富集处理技术,确保下机数据中靶基因含量>10%;

4.能够按要求上传完整的基因序列数据至公共数据库NCBI、GISAID、中国流感病毒基因序列数据库、以及国家致病菌识别网或病毒病病原监测系统等;

5.对病原体核酸抽提、病原体富集、文库构建、测序以及数据分析整个流程提供整体服务;

6.测序数据质量:Q30>90%,高质量数据>1G;组装结果:0 gap,平均覆盖深度>8000x;

7.所送样本核酸(非PCR产物)CT值小于25的须保证测序成功;

8.测序报告包含原始数据整理及质量评估、序列拼接结果和原始数据等内容,另外可有偿提供专业的病毒基因系统进化、关键基因位点分析服务;

9.同一厂家可提供五种腹泻类病毒全基因组捕获试剂盒,涵盖诺如,星状,札如,轮状,肠道等(提供生产厂家盖章说明书原件),在紧急情况下能够满足用户自测或外送测序需求。

四、急性呼吸道传染病样本二代宏基因组测序

1.服务内容:对符合生物安全的生物样本进行宏基因组测序(二代高通量测序)及后续的数据质控,交付完整原始数据、宏基因组分析数据和报告。

2.服务要求:

2.1宏基因组测序内容:

2.1.1核酸(DNA和RNA)质量检测:DNA提取物OD260/OD280在1.7-1.9之间,OD260/OD230在2.0-2.5之间,荧光检测仪检测总DNA量在100ng以上,去宿主处理,1%琼脂糖凝胶电泳测定DNA主带应在400bp以上。RNA提取物的OD260/OD28超过1.8,RNA完整度检测,并进行使用DNase进行处理;

2.1.2高通量测序文库构建的技术指标和要求:文库DNA的OD260/OD280在1.7-2.0之间;文库片段大小为插入片段和接头序列的总长度。文库插入片段长度应符合所选测序读长的需求;文库主峰明显、无杂峰、无接头、无引物二聚体。RNA样本转换成双链DNA后进行后续的测序流程;

2.1.3测序策略:双端测序,PE150或PE250及以上;

2.1.4服务方应采用高通量测序技术进行建库测序,每个样品产生的平均原始数据≥10G,测序数据中Q30以上占比≥85%,最终单份样本reads数目≥50M;

2.2测序数据分析内容:

2.2.1下机原始数据需进行数据质量过滤,包括过滤测序接头、低质量序列、低复杂度序列、重复序列;

2.2.2宿主参考序列数据库:至少包括人类基因组参考序列,且需不仅收录人类染色体基因组,还需包括线粒体等基因组、转录组序列信息;

2.2.3物种鉴定:物种鉴定参比数据库中需涵盖细菌、真菌、病毒、寄生虫等微生物,以微生物物种分类注释为目的,微生物种属的种类不得少于Refseq数据库中的微生物种类;推断纳入微生物参考基因组数据库FDA-ARGOS及参考病毒数据库FDA-RVDB;剔除冗余、错误及不完整数据,选择高质量、组装完整的序列。分析工具可以采用基于Kmer算法,也可基于物种特异性基因进行比对;

2.2.4毒力基因鉴定:毒力基因参比数据库中基因不得少于VFDB数据库中经实验验证的毒力基因,推荐每年至少更新版本一次;

2.2.5耐药基因鉴定:耐药基因参比数据库推荐使用CARD或Resfinder或MEGARes数据库,推荐每年至少更新版本一次。

2.3报告要求:报告病原体信息原则上准确到种,同时也应包括相应的属信息;报告内容应包括:检测到的所有微生物列表,对应的比对总序列数量、对应的唯一比对序列数量、相对丰度。毒力基因和耐药基因需标明每个基因的测序覆盖度和测序深度。将传染病法中规定需要关注的病原体特殊呈现。同时,报告中还应标明所使用的数据库情况、比对策略说明。


注:1.服务方提供标本运输保存工具,确保标本不发生降解、溶解。服务方至少具有一台低温冷链车,提供运输保障,需提供行驶证复印件和冷链车合格证佐证,服务方上门接收样本,7个工作日内完成测序和数据交付,并提供后续相关数据质控和分析服务,紧急样本2个工作日完成,包含生信分析服务。

2.服务方对检测资料及数据严格保密,不得对外泄露。


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