招标详情
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400-688-2000
项目名称
| 表观遗传检测 | 项目编号
**** |
公告开始日期
| 2026-07-08 09:46:46 | 公告截止日期
2026-07-13 10:00:00 |
采购单位
| **** | 付款方式
货到验收付款 |
联系人
| 联系电话
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签约时间要求
| 到货时间要求
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预算总价
| ￥234000.00 |
发票要求
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含税要求
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送货要求
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安装要求
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收货地址
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供应商资质要求
| 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 |
公告说明
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采购商品 采购数量 计量单位 所属分类
| 表观遗传分析 |
1 |
项 |
其他自然科学研究和试验开发服务 |
品牌
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型号
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预算单价
| ￥ 234000.00 |
技术参数及配置要求
| 一、项目总体概述 本项目针对科研来源的15份小鼠皮肤组织样本，开展转录组、全基因组DNA甲基化及组蛋白修饰等多维度表观遗传联合测序分析，系统解析皮肤样本在特定生理或病理状态下的基因表达调控特征，为皮肤疾病机制研究、潜在治疗靶点筛选及表观遗传标志物挖掘提供高通量测序与生物信息学分析支撑。 项目需实现样本核酸提取、文库构建、高通量测序、数据质控、基础分析及定制化生物信息学分析等全流程服务。各实验和分析环节应符合高通量测序行业通用质量控制要求，最终交付可用于后续科研分析和论文撰写的数据文件、质控报告和分析报告。 本项目不限定唯一技术路线。投标方可根据项目研究目标、样本类型和数据质量要求，采用成熟稳定的测序与分析方案，并在投标文件中明确说明技术路线、实验流程、质控标准、数据分析流程及未达标情况下的处理方案。 二、分项服务技术要求 1.全基因组DNA甲基化测序（WGBS）服务 采用重亚硫酸盐转化建库测序技术，实现单碱基分辨率下全基因组范围内所有胞嘧啶位点的甲基化状态精准检测，作为DNA甲基化研究的金标准方案，覆盖CG、CHG、CHH三类甲基化序列环境。 实验流程：完成皮肤组织基因组DNA的提取与质控，经亚硫酸盐转化处理后构建链特异性测序文库，采用高通量测序平台完成测序；要求每个样本产出 85 Gb数据（ Rawdata），单个样品产出测序数据量不低于目标数据量的90%，Q20≥80%。 1.1基础分析内容：包含基因组比对统计、全基因组平均甲基化水平评估、不同序列环境下甲基化位点分布统计、染色体层面甲基化密度分布图谱绘制、基因转录元件（启动子、5'UTR、外显子、内含子、3'UTR）的甲基化水平分层统计。 1.2高级分析内容：开展样本间甲基化水平相关性分析、主成分分析、聚类分析，筛选差异甲基化区域（DMR）并完成对应的靶基因注释，对DMR关联基因开展GO功能富集、KEGG通路富集分析，结合项目背景定制差异甲基化位点的可视化展示与临床/病理特征关联分析。 1.3送样适配要求：支持新鲜皮肤组织、冻存组织等多种样本类型，针对降解程度较高的FFPE样本需提供优化的DNA提取与建库方案，保障文库多样性与数据有效性。 2.三种组蛋白修饰ChIP-Seq检测服务 针对皮肤组织开展H3K4me3、H3K27ac、H3K27me3三类核心组蛋白修饰的染色质免疫共沉淀测序，精准捕获全基因组范围内对应修饰的DNA富集区域，解析表观修饰对基因转录的调控模式。 2.1实验流程：完成皮肤组织的细胞核提取与染色质超声片段化，采用经ChIP级验证的高特异性抗体开展免疫沉淀实验，富集得到对应的DNA片段后构建测序文库；要求IP实验的富集效率满足行业质控标准，阴性对照与阳性对照设置完整，每个文库产出6Gb Rawdata，单个样品产出测序数据量不低于目标数据量的90%，Q20≥80%。 2.2基础分析内容：包含测序数据比对统计、全基因组修饰峰（peak）的鉴定与注释、修饰峰在不同基因功能元件上的分布统计、样本间修饰峰的重叠与差异分析。 2.3高级分析内容：针对H3K4me3（启动子活跃标记）开展启动子区域富集特征分析、关联基因的表达相关性预分析；针对H3K27ac（增强子/超增强子活跃标记）鉴定潜在超级增强子区域、预测下游靶基因与关键转录因子基序富集；针对H3K27me3（转录抑制标记）分析沉默基因的修饰分布特征，最终完成三类组蛋白修饰的联合调控网络整合分析。 2.4抗体质控要求：所用H3K4me3、H3K27ac、H3K27me3抗体应适用于ChIP-seq或相关染色质免疫富集实验。投标方需提供抗体名称、来源、货号、批号及适用性证明材料，包括但不限于厂家说明、既往验证资料、文献使用记录、预实验验证结果或项目质控结果。 本项目不限定特定抗体品牌、特定供应商或特定批次抗体。投标方应保证所用抗体具有良好的特异性和稳定性，避免非特异性富集对结果造成影响。 3.转录组测序（RNA-seq）服务 构建皮肤组织的链特异性mRNA测序文库，全面解析样本在特定状态下的基因表达谱，同时覆盖可变剪接、新转录本发现、基因融合等结构变异分析内容。 3.1实验流程：完成皮肤组织总RNA提取与质控，要求RNA完整度值RIN≥7，通过Oligo dT富集mRNA后构建链特异性测序文库，采用高通量测序平台完成测序；单个样本测序数据量不低于6G，Q30碱基占比≥90%，GC含量无显著物种特异性偏移。 3.2基础分析内容：包含原始数据预处理与质控、与参考基因组的比对统计、基因表达丰度定量分析，提供样本间主成分分析、相关性分析、基因表达分布可视化图谱。 3.3高级分析内容：完成差异表达基因筛选、差异基因聚类分析、火山图与热图绘制，针对差异基因开展GO、KEGG、DO多维度功能富集分析，同时纳入可变剪接事件鉴定、新转录本注释、差异可变剪接基因的功能解析。 三、多组学联合整合分析服务 需将WGBS甲基化数据、三类组蛋白修饰ChIP-seq数据与RNA-seq基因表达数据进行跨组学关联整合，构建皮肤组织的表观遗传调控全景图谱： 1.联合分析甲基化修饰与组蛋白修饰在基因启动子区域的协同分布模式，解析“开放活跃染色质”与“紧密沉默染色质”的表观特征组合； 2.关联DNA甲基化异常、组蛋白修饰富集变化与基因差异表达的对应关系，筛选受多层表观调控共同影响的关键致病基因与核心信号通路； 3.结合项目实验分组、表型信息及皮肤组织相关研究背景，开展定制化多组学关联分析，筛选可能与研究表型相关的候选调控基因、候选表观遗传标志物及潜在功能通路，形成规范化整合分析图表、结果说明和生物信息学分析报告，为后续科研论文撰写和机制研究提供数据支持。 四、项目通用服务规范 1.所有实验环节需提供完整的原始记录与质控报告，包含核酸检测报告、文库质检报告、测序数据质控报告，确保实验流程可追溯； 2.提供1对1专属项目对接人与生物信息分析师，全程跟进项目进度，针对分析过程中的个性化需求提供定制化调整服务； 3.项目交付周期从样本合格入库之日起，总周期不超过40个工作日，所有原始测序数据、中间分析文件、最终分析报告需通过加**盘交付，提供至少3个月的云端数据存储备份服务以及12个月售后咨询期； 4.投标方应具备高通量测序、表观遗传组学或多组学联合分析相关服务经验，能够完成样本处理、文库构建、测序质控和生物信息学分析等工作。 投标方可提供非涉密项目案例、服务合同、验收材料、分析报告样例、技术方案说明或其他能够证明其服务能力的材料。已发表**成果可作为技术能力参考，不作为资格性或排他性条件。 具有小鼠组织样本、皮肤组织样本或类似组织样本处理经验者，在同等条件下可作为技术评价参考。标书代写 |
参考链接
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