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江苏姜曲海猪种业有限公司 - 竞价公告（CFJQHZ2026000004）
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**** - 竞价公告（****）
发布时间：2026-07-10 16:30:56 截止时间：2026-07-13 16:40:46标书代写
申购主题： 1例猪T2T基因组组装、注释及分析
报价要求： 国产含税
发票类型： 增值税普通发票
付款方式： 货到验收合格后付款
收货地址： **省/**市/**区/****
供应商资质：
备注说明：
送货时间： 发布竞价结果后3天内送达
安装要求： 免费上门安装（含材料费）
预算： 48000.0人民币
| 1例猪T2T基因组组装、注释及分析 | 1.0/例 | 48000.0 | 1、T2T基因组常染色体组装 利用Nanopore promethION48测序平台完成后的ONT超长reads进行denovo组装。质量要求：基因组无gap，中部着丝粒、亚中部着丝粒、亚端部着丝粒染色体2端端粒完整，着丝粒无缺失且端着丝粒（Chr13、Chr14、Chr15、Chr16、Chr17、Chr18）的染色体组装完整，基因组QV值达到Q45及以上。 2、T2T基因组Y染色体组装 利用DNBSEQ-T7平台测序的亲本、子代二代reads和子代Nanopore promethION48平台测序的ONT超长reads进行分型组装。质量要求：Y染色体长度至少40M，Y染色体着丝粒完整，2端端粒完整，Y染色体reads覆盖均匀。 3、基因组注释 利用illumina Novaseq平台测序出来的9个二代转录组及9个三代全长转录组和近源种的蛋白进行注释。质量要求：蛋白编码基因数量2万左右，重复序列注释含量46%左右，平均基因长度46k左右。 4、比较基因组分析 共线性分析：与近缘物种进行共线性(Collinearity)比较，绘制共线性比较图，解析基因组结构差异(如染色体重排、倒位、易位)。 进化与变异分析：进行基因家族聚类、系统发育树构建、物种分化时间推算、基因家族收缩/扩张分析、Ka/Ks偏倚分析。 5、其他 其他未尽事项均在合同中约定，并在沟通中适度调整。 | 1、提供至少2个发表文章达IF>=10的T2T基因组组装案例 2、数据终身保密，数据保存期为1年，保存期到期后及时销毁不得外泄，保存期间提供不限次硬盘拷贝数据服务。 3、分析人员需与客户建立直接联系，定期沟通及反馈分析进度与结果、及时调整分析方法与策略，不得经第三人进行转达沟通。 4、项目需在45个自然日内完成。 |
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2026-07-10
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