乌什县疾病预防控制中心(卫生监督所)结核分枝杆菌基因组测序及生信分析第三方服务项目竞价公告

发布时间: 2026年09月08日
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一、项目信息

项目名称: ********监督所)结核分枝杆菌基因组测序及生信分析第三方服务项目

项目编号:****
项目联系人及联系方式: 马斯扬 132****6701

报价起止时间:2026-09-08 10:44 - 2026-09-11 20:00

采购单位:********监督所)

供应商规模要求: -

供应商资质要求: -

供应商基本要求:符合《****政府采购法》第二十二条的规定。


二、采购需求清单

商品名称 参数要求 购买数量 控制金额(元) 意向品牌
基因组分析服务 核心参数要求:
商品类目: 基因组分析服务; 二代测序::;1)核酸提取:提供对灭活后的结核分枝杆菌样本基因组提取服务,同时对基因组进行质检,并提供样本基因组质检报告;;2)文库类型:350bp小片段文库;;3)测序平台:Illumina测序平台;;4)测序策略:PE150;;5)测序深度:≥200X;;6)测序覆盖度:>99%;;7)测序数据量:≥1G/样本;;8)原始下机数据测序质量要求:平均Q20≥90%,平均Q30≥85%;;9)低质量序列过滤、接头(adapter)序列去除:原始数据(Raw Data)进行去除接头和低质量read的处理,得到有效数据(Clean Data);;10)交付形式:raw data 和clean data,供应商提供移动硬盘进行数据交付。;11)交付周期:分批次送样,收到样本后12个工作日内完成。;三代测序::;1)核酸提取:提供对灭活后结核分枝杆菌样本基因组提取服务,同时对基因组进行质检,并提供样本基因组质检报告;;2)文库类型:10Kb SMRT Bell文库;;3)测序平台:PacBio HIFI;;4)测序深度:≥100X;;5)低质量序列过滤、接头(adapter)序列去除:原始数据(Raw Data)进行去除接头和低质量read的处理,得到有效数据(Clean Data);;6)交付形式:raw data 和clean data和成环基因组。;分析要求::;(1)基础分析::;参数:1)基因组组装和质控统计;;2)基因组组分分析:编码基因、非编码RNA、前噬菌体、整合子、插入序列、基因岛、CRISPR-Cas;;3)基因功能注释:GO、KEGG、COG、NCBI Taxonomy;;4)病原细菌致病性和耐药性分析:细菌致病菌毒力因子(VFDB)注释、耐药基因(CARD)注释、分泌蛋白预测。;(2)结核分枝杆菌定制化分析::;1)菌种鉴定:识别结核分枝杆菌(MTBC)或非结核分枝杆菌(NTM),可识别的NTM种数不少于175种。;2)比较基因组分析:SNP/InDel变异检测及注释;;3)谱系鉴定:基于变异检测结果的谱系鉴定;;4)耐药性分析:基于变异检测结果的耐药预测,包含所有一线药物和部分二线药物,共计21种药物;;5)群体进化分析::;参数:a)遗传距离分析(近期传播关系鉴定);参数:b)群体进化树分析;参数:6)混合感染鉴定;;7)基因组可视化分析(只针对三代测序数据):基因组图谱圈图展示。;标本运输:由供应商负责提供灭活后检测标本(输出标准SOP)相关包装和运输要求运输,并承担相关运输费用。;采购人需求描述:符合附件中相关资质;

次要参数要求:
1件 100000.00 -

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附件: 结核分枝杆菌全基因组测序及生信分.doc

响应附件要求:营业执照、法人身份证,本项目的特定资格要求:投标人至少具有ISO9001质量管理体系证书、ISO13485质量管理体系证书,ISO14001环境管理体系认证证书或ISO45001职业健康安全管理体系认证证书中的一个;****实验室具备二级生物安全水平(BSL-2),****实验室备案证书;


三、收货信息

送货方式: 送货上门

送货时间: 工作日09:00-17:00

送货期限: 竞价成交后7个工作日内

送货地址: **维吾尔自治区 **地区 **县 **镇 ****县**镇胜利中路135号

送货备注: -


四、商务要求

商务项目 商务要求

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乌什县疾病预防控制中心(卫生监督所)结核分枝杆菌基因组测序及生信分析第三方服务项目竞价公告
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