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| 全晰空间蛋白组 | 2.0/例 | 60000.0 | 全晰空间蛋白组技术基于相邻连续组织切片,结合H E全切片扫描、图像配准、激光显微正交条带切割与DIALCMS/MS质谱检测,实现组织原位蛋白质二维空间重构分析。首先制备相邻连续组织切片,选取其中一张切片开展H E染色与全切片扫描,获取组织形态、病理分区、解剖结构信息,为区域划定提供形态学参考;剩余两套相邻切片分别用于0°、90°正交方向条带切割。将两套待切割切片完成全切片数字化扫描后导入QuPath软件,以一张切片作为参考模板,另一张作为待配准图像,依靠组织轮廓与特征解剖结构,通过平移、旋转、尺度变换完成切片图像配准,统一两套切片至同一空间坐标系,人工校验配准效果;受连续切片本身形态差异影响,局部边缘可存在轻微配准偏移。依据目标组织轮廓与设定空间分辨率,在两张切片上分别设计0°与90°方向50μm等宽连续平行条带,完整覆盖目标组织区域,记录全部条带编号、空间坐标;将切割轮廓转换为LMD识别的xml格式文件,采用Leica LMD7激光显微切割系统,按预设正交条带逐一切割收集,每一条带作为独立空间投影样本,留存切割方向、编号与位置信息。收集得到的条带微量组织样本经过蛋白提取、蛋白酶解处理,采用液相色谱串联质谱LCMS/MS进行DIA模式数据采集,使用DIANN软件完成蛋白质的鉴定与定量;结合0°、90°双向正交条带的空间坐标与蛋白定量结果,完成二维空间蛋白信号重构,开展空间蛋白表达特征解析以及配套生物信息学分析。该技术兼容新鲜冷冻组织与FFPE石蜡组织样本,可获取组织原位无偏蛋白表达空间分布信息。 | (1) 本项目服务期为1年。(2) 质量保证期为2年。(3) 其他:1.为课题组人员做好项目研究前的市场调查及检索等工作。 2.提供完善的售前售后服务和快速的响应机制,从方案设计、样本收集到数据分析,提供一对一的专业技术对接,协助报告解读、数据深入挖掘,并提供相应产品的中英文方法学,满足文章发表需求; 3.对于课题组人员的个性化需求应予以满足,并做好联络沟通。 4.项目进行期间,响应人需免费提供相关的技术咨询服务,及时解答采购人对于本项目的技术相关问题,并提供必要的技术培训。 5.售后相应周期不超过一个工作日,处理售后任务周期根据任务难度平均不超过五个工作日 | |||
| 10x visium HD 空间转录组 | 2.0/例 | 24000.0 | 10× Visium HD空间转录组对组织进行检测,基于组织样本的空间分布特征,在完整组织切片中实现亚细胞分辨率的转录组分析,核心优势在于极高的空间分辨率与基因检测灵敏度。组织切片通过CytAssist仪器转移至Visium HD芯片,简化样本前处理流程;其专属物种探针(针对人和小鼠设计)通过三对探针靶向杂交,极大提升基因检出效率与灵敏度。芯片捕获区域为6.5 mm × 6.5 mm,采用2 μm × 2 μm连续正方形捕获单元(bin),支持按8 μm/16 μm等不同bin聚合分析,实现亚细胞分辨率的空间定位与定量,单样本捕获单元达数百万个;每个捕获单元含空间条形码、UMI序列与poly(dT),兼容FFPE及新鲜冷冻(OCT)组织样本。建议单样本测序量≥10–20 Gb clean data,采用10x Space Ranger及Loupe Browser进行数据比对、分bin定量、空间可视化与差异分析。交付内容包含空间基因表达矩阵、聚类/细胞注释结果、空间可视化图谱、质控报告及方法学描述。 | (1) 本项目服务期为1年。(2) 质量保证期为2年。(3) 其他:1.为课题组人员做好项目研究前的市场调查及检索等工作。 2.提供完善的售前售后服务和快速的响应机制,从方案设计、样本收集到数据分析,提供一对一的专业技术对接,协助报告解读、数据深入挖掘,并提供相应产品的中英文方法学,满足文章发表需求; 3.对于课题组人员的个性化需求应予以满足,并做好联络沟通。 4.项目进行期间,响应人需免费提供相关的技术咨询服务,及时解答采购人对于本项目的技术相关问题,并提供必要的技术培训。 5.售后相应周期不超过一个工作日,处理售后任务周期根据任务难度平均不超过五个工作日 |