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【采购公告】 基于咽拭子样本的DNA-RNA共提取与高通量共建库测序及多组学联合分析服务
招标详情
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400-688-2000
项目信息
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项目编号：****
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项目名称：基于咽拭子样本的DNA-RNA共提取与高通量共建库测序及多组学联合分析服务
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采购方式：公开询价邀请询价竞争性谈判竞争性磋商单一来源采购项目比选商品比选
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评审办法： 有效最低价 综合评估法
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项目类型： 技术服务
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预算金额***
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采购人信息
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采购单位:***
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联系人:***
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商品信息
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商品信息
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预算单价
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商品参数
商品备注
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基于咽拭子样本的DNA-RNA共提取与高通量共建库测序及多组学联合分析服务 品牌：无 货号/型号：无 规格：批
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技术指标： 1、检测目标与适用范围：在同一前处理及检测流程内同步完成咽拭子病原微生物DNA型与RNA型病原体的识别与鉴定。要求供应商提供共提取-共建库-测序-分析一体化方案，实现“一份样本、双重核酸、同步检出”的核心目标。 2、样本保存与转运管理：样本送达后，供应商应在样本尚未发生融冻的状态下，即刻将其转移至-80°C超低温冰箱中进行保存，杜绝因反复冻融导致的核酸降解与完整性损失。 3、核酸提取：采用基于磁珠分离原理的病原微生物DNA/RNA共提取试剂盒，对口咽拭子保存液样本开展DNA与RNA的共提取。提取产物须经多维质控手段完成综合评价，核酸质控合格标准包括：核酸总产出量≥ 100 ng，纯度（A260/A280）为1.5 ≤ 比值 ≤ 2.2，基因组主带分子量≥ 10 kb，片段主带清晰、完整性强，无明显降解弥散带。 4、文库构建：选用病原微生物mNGS专用建库试剂体系，对上述质控合格的核酸样本执行DNA与RNA的一体化共建库操作。建库流程须涵盖片段化、接头连接、反转录（RNA部分）、扩增富集等关键步骤。文库质控合格标准如下：浓度≥ 8 ng/μL，总量≥ 100 ng，插入片段主峰350bp，无明显非特异大片段污染。 5、高深度测序：依托MGI高通量测序平台实施二代测序（NGS）策略，对共建库产物进行高深度测序。各项测序产出指标须满足：单文库有效数据产出量≥ 16 Gbp，测序碱基质量值 Q30 比例≥ 90%，实际总数据产出率≥ 约定总量的 90%。 6、多组学联合分析：在完成高通量测序数据产出的基础上，供应商须提供宏基因组分析服务，标准分析流程须包含：原始数据质控（接头去除、低质量reads过滤、宿主序列去除）、de novo组装、参考基因组比对、物种注释及功能注释等完整步骤。具体用到的分析软件至少包含KneadData、FastQC、Trimmomatic、Bowtie2、MEGAHIT、Prokka、Salmon 、BLAST、eggnog-mapper、dbCAN2、 RGI等主流软件，用到的数据库至少包含KEGG、eggNOG、CAZy及 CARD等代谢功能数据库。
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7、样本规模：本项目计划纳入咽拭子样本共计450例。供应商须按上述技术要求逐例完成核酸共提取、共建库、测序及多组学联合分析全流程。 8、项目交付周期：自收到样品至分析报告释放，周期不超过4周。 9、数据存储：供货商具备大数据存储能力，数据有效存储期限不低于8个月。 10、数据交付：数据释放方式为云盘释放，便于上传至服务器，测序数据为fastq格式，云盘保存期限大于三周。 11、项目验收与报告要求：项目结束后提供结题报告中要包含上述指标，并在服务周期中形成实时表格进行记录。确保各环节技术指标可追溯、可核查。结题报告须经采购方审核确认后方可视为项目验收通过。
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内容公告
见附件
附件（1）
基于咽拭子样本的DNA-RNA共提取与高通量共建库测序及多组学联合分析服务项目说明.docx下载预览
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