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项目编号:****
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项目名称:临床队列样本多组学测序项目
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采购方式:公开询价邀请询价竞争性谈判竞争性磋商单一来源采购项目比选商品比选
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评审办法: 有效最低价 综合评估法
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项目类型: 技术服务
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预算金额***
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采购单位:***
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联系人:***
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电话:***
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地址:***
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邮箱:***
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临床队列样本多组学测序项目 品牌:无 货号/型号:无 规格:项
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项
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技术指标: (1)样本接收与前处理、DNA和RNA共提取:接收采购方提供的临床队列样本350例(包括但不限于肠道内容物,微生物拭子等)。 (2)完成样本登记、编号,采用基于磁珠分离原理的病原微生物DNA/RNA共提取试剂盒对微生物DNA和RNA共提取。 (3)对提取产物逐样进行质量评价并出具报告。 (4)要求核酸总产出量≥ 100 ng。 (5)纯度比值1.5 ≤ A260/A280≤ 2.2,片段完整性高,主带清晰,无明显降解弥散带。 (6)文库构建:选用病原微生物专用建库试剂体系,对上述质控合格的核酸样本执行DNA与RNA的一体化共建库操作,采用去rRNA建库策略去除核糖体RNA,完成双链cDNA合成并按MGI体系进行文库构建,逐文库开展库检。 (7)要求文库浓度≥2 ng/μL,文库总量≥ 100 ng。 (8)文库插入片段平均长度在200 bp至600 bp,无明显非特异大片段峰,rRNA残留率按不高于30%控制。 (9)测序:合格文库在DNBSEQ-T7超高通量测序平台上机,测序策略为双端150bp(PE150)。 (10)单样数据产出量不低于20G,数据量达成率不低于98%。 (11)数据质控:对下机原始数据进行质量检测,完成接头序列切除、低质量碱基修剪与低质量序列过滤,并剔除污染序列。 (12)质控结果应满足Q30比例不低于85%,有效数据过滤比例不低于90%,序列比对率不低于90%。 (13)数据分析:按标准流程提供生物信息学分析,内容包含拼接、物种与功能注释(NR/NT、eggNOG/KEGG、GO、CAZy、ARG/VFDB 等)、基因丰度定量(TPM/RPM)、α/β多样性与排序(PCA/PCoA/NMDS)、差异基因/通路富集(FDR≤0.05,|log2FC|≥1)、关键功能贡献与相关性网络分析。要求交付 FASTQ/BAM、表达矩阵、统计图表及结题报告。 (14)数据交付与存储:完成全部样本数据的传输与交付,支持**云、华为云、硬盘等多种交付方式,由采购方选择。提供数据存储服务,数据有效保存期限不少于1年。 (15)项目周期:自采购方送样之日起,至完成提取、建库、测序及生物信息学分析并交付数据,总周期不超过30个自然日。
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配置要求: (1)质量文件:能够提供服务范围内各项技术指标对应的质量控制报告。 (2)售后支撑:具备售后服务与技术支撑能力,应答时间小于48小时,服务响应期不少于1年。 (3)平台能力:承接方自有DNBSEQ-T7测序平台不少于5台,具备大规模高通量测序数据产出能力。
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