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中国疾病预防控制中心传染病预防控制所基因组二代三代测序采购项目成交公告
招标详情
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400-688-2000
相关单位：
***********公司企业信息
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一、项目编号：****（招标文件编号：****）
二、项目名称：基因组二代三代测序采购项目
三、中标（成交）信息
供应商名称：****
供应商地址：**市**区康新公路 3399 弄 3 号
中标（成交）金额：11.****000（万元）
四、主要标的信息
| 序号 | 供应商名称 | 服务名称 | 服务范围 | 服务要求 | 服务时间 | 服务标准 |
| 1 | **** | 基因组测序（细菌基因组框架图）、基因组测序（细菌基因组完成图） | 传染病所 | 华大平台/Illumina平台，PE150、PacBio平台 | 合同签订后18个月 | 1.数据量要求：PE150及以上测序；原始数据量（碱基数）≥1.5G；Q20高质量数据量（Clean data）≥1G。 2.质量要求：基因组覆盖度≥95%，基因区覆盖度≥98%，整体覆盖深度≥100×；碱基数据质量值Q30比例≥85%；SCAFFOLD数量＜100个，Contig数量＜200个；单碱基错误率低于十万分之一。 3.交付内容：1）DNA样本建库；2）原始数据统计：reads条数、reads长度、是否paird数据、数据总量；3）高质量数据过滤：（1）需要过滤掉含有接头序列的reads；（2）当任意一端read中含有的N或低质量位点（如低于Q20）的含量超过read长度的3%时，需要去除此对reads；4）有效数据统计：reads条数、reads长度、是否paird数据、数据总量、有效数据占原始数据的百分比；5）序列组装；6）组装结果统计：长度大于1K的Scaffold数量、N50长度、Scaffold总长度、GC含量、最大长度的Scaffold长度。 1.数据量要求：原始数据量（碱基数）≥750M；Q20高质量数据量（Clean data）≥600M。 2.质量要求：基因组覆盖度100%，基因区覆盖度100%，整体覆盖深度≥100×；碱基数据质量值Q30比例≥85%；基因组完全合并，Contig数量1个；单碱基错误率低于十万分之一。 3.交付内容：1）DNA样本建库；2）原始数据统计：reads条数、reads长度、是否paird数据、数据总量；3）高质量数据过滤：（1）需要过滤掉含有接头序列的reads；（2）当任意一端read中含有的N或低质量位点（如低于Q20）的含量超过read长度的3%时，需要去除此对reads；4）有效数据统计：reads条数、reads长度、是否paird数据、数据总量、有效数据占原始数据的百分比；5）序列组装；6）组装结果统计：组装后染色体大小、质粒数量和大小、gap数量（应为0）以及测序覆盖深度。 |
五、评审专家（单一来源采购人员）名单：
常军、刘媺、荣蓉
六、代理服务收费标准及金额：
本项目代理费收费标准：无
本项目代理费总金额：0.000000 万元（人民币）
七、公告期限
自本公告发布之日起1个工作日。
八、其它补充事宜
无
九、凡对本次公告内容提出询问，请按以下方式联系。
1.采购人信息
名 称：****
地址：**市**区昌百路155号传染病所
联系方式：王老师；010-****0715；****@icdc.cn
2.项目联系方式
项目联系人：胡老师
电 话： ****0784
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